RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565787.1

CHTF18-216, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 607 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-216ENST00000565787 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.25■■■■■ 6.92
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CHTF18-216ENST00000565787 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.05■■■■■ 5.44
CHTF18-216ENST00000565787 NACADO15069 1562 aa48.91■■■■■ 5.42
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CHTF18-216ENST00000565787 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.53■■■■■ 5.36
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CHTF18-216ENST00000565787 SCRIBQ14160 1630 aa47.37■■■■■ 5.17
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CHTF18-216ENST00000565787 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.06■■■■■ 5.12
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CHTF18-216ENST00000565787 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.1■■■■■ 4.81
CHTF18-216ENST00000565787 SMARCA2P51531 1590 aa45.03■■■■■ 4.8
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CHTF18-216ENST00000565787 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.89■■■■■ 4.78
CHTF18-216ENST00000565787 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.87■■■■■ 4.77
CHTF18-216ENST00000565787 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
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CHTF18-216ENST00000565787 NESP48681 1621 aa44.15■■■■■ 4.66
CHTF18-216ENST00000565787 ERCC6Q03468 1493 aa44.05■■■■■ 4.64
CHTF18-216ENST00000565787 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.01■■■■■ 4.64
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CHTF18-216ENST00000565787 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.68■■■■■ 4.58
CHTF18-216ENST00000565787 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.67■■■■■ 4.58
CHTF18-216ENST00000565787 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
CHTF18-216ENST00000565787 CFTRP13569 1480 aa43.46■■■■■ 4.55
CHTF18-216ENST00000565787 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.37■■■■■ 4.53
CHTF18-216ENST00000565787 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.28■■■■■ 4.52
CHTF18-216ENST00000565787 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.27■■■■■ 4.52
CHTF18-216ENST00000565787 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.25■■■■■ 4.51
CHTF18-216ENST00000565787 PRDM2Q13029 1718 aa43.22■■■■■ 4.51
CHTF18-216ENST00000565787 WDR62O43379 1518 aa43.17■■■■■ 4.5
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CHTF18-216ENST00000565787 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.75■■■■■ 4.43
CHTF18-216ENST00000565787 TOPBP1Q92547 1522 aa42.57■■■■■ 4.41
CHTF18-216ENST00000565787 ABCC8Q09428 1581 aa42.52■■■■■ 4.4
CHTF18-216ENST00000565787 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.51■■■■■ 4.4
CHTF18-216ENST00000565787 IFT140Q96RY7 1462 aa42.36■■■■■ 4.37
CHTF18-216ENST00000565787 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
CHTF18-216ENST00000565787 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
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CHTF18-216ENST00000565787 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.99■■■■■ 4.31
CHTF18-216ENST00000565787 SOGA1O94964 1423 aa41.97■■■■■ 4.31
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CHTF18-216ENST00000565787 WDR97A6NE52 1622 aa41.8■■■■■ 4.28
CHTF18-216ENST00000565787 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
CHTF18-216ENST00000565787 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.73■■■■■ 4.27
CHTF18-216ENST00000565787 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.69■■■■■ 4.27
CHTF18-216ENST00000565787 TOP2BQ02880 1626 aa41.69■■■■■ 4.27
CHTF18-216ENST00000565787 SYNJ1O43426 1573 aa41.67■■■■■ 4.26
CHTF18-216ENST00000565787 CHD1O14646 1710 aa41.64■■■■■ 4.26
CHTF18-216ENST00000565787 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.61■■■■■ 4.25
CHTF18-216ENST00000565787 GRIN2BQ13224 1484 aa41.53■■■■■ 4.24
CHTF18-216ENST00000565787 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.53■■■■■ 4.24
CHTF18-216ENST00000565787 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.52■■■■■ 4.24
CHTF18-216ENST00000565787 PBRM1Q86U86 1689 aa41.51■■■■■ 4.24
CHTF18-216ENST00000565787 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.49■■■■■ 4.23
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CHTF18-216ENST00000565787 FBLN2P98095 1184 aa41.41■■■■■ 4.22
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CHTF18-216ENST00000565787 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.28■■■■■ 4.2
CHTF18-216ENST00000565787 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.28■■■■■ 4.2
CHTF18-216ENST00000565787 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.28■■■■■ 4.2
CHTF18-216ENST00000565787 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
CHTF18-216ENST00000565787 ARHGEF11O15085 1522 aa41.21■■■■■ 4.19
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CHTF18-216ENST00000565787 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.15■■■■■ 4.18
CHTF18-216ENST00000565787 ADAMTS12P58397 1594 aa41.13■■■■■ 4.18
CHTF18-216ENST00000565787 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.12■■■■■ 4.17
CHTF18-216ENST00000565787 GRIN2AQ12879 1464 aa41.02■■■■■ 4.16
CHTF18-216ENST00000565787 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41■■■■■ 4.15
CHTF18-216ENST00000565787 ARAP1Q96P48 1450 aa40.86■■■■■ 4.13
CHTF18-216ENST00000565787 NUP160Q12769 1436 aa40.85■■■■■ 4.13
CHTF18-216ENST00000565787 CEP170Q5SW79 1584 aa40.85■■■■■ 4.13
CHTF18-216ENST00000565787 KIF27Q86VH2 1401 aa40.84■■■■■ 4.13
CHTF18-216ENST00000565787 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.77■■■■■ 4.12
CHTF18-216ENST00000565787 IGF1RP08069 1367 aa40.74■■■■■ 4.11
CHTF18-216ENST00000565787 CUL7Q14999 1698 aa40.7■■■■■ 4.11
CHTF18-216ENST00000565787 SHROOM2Q13796 1616 aa40.63■■■■■ 4.09
CHTF18-216ENST00000565787 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.55■■■■■ 4.08
CHTF18-216ENST00000565787 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.54■■■■■ 4.08
CHTF18-216ENST00000565787 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.47■■■■■ 4.07
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