RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567620.1

CHTF18-217, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-217ENST00000567620 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-217ENST00000567620 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.29■■■□□ 2.76
CHTF18-217ENST00000567620 ABCC9O60706 1549 aa32.03■■■□□ 2.72
CHTF18-217ENST00000567620 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.81■■■□□ 2.52
CHTF18-217ENST00000567620 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.61■■■□□ 2.49
CHTF18-217ENST00000567620 NACADO15069 1562 aa30.49■■■□□ 2.47
CHTF18-217ENST00000567620 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.15■■■□□ 2.42
CHTF18-217ENST00000567620 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-217ENST00000567620 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
CHTF18-217ENST00000567620 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.94■■■□□ 2.38
CHTF18-217ENST00000567620 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.79■■■□□ 2.36
CHTF18-217ENST00000567620 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.63■■■□□ 2.33
CHTF18-217ENST00000567620 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.62■■■□□ 2.33
CHTF18-217ENST00000567620 SCRIBQ14160 1630 aa29.58■■■□□ 2.33
CHTF18-217ENST00000567620 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.25■■■□□ 2.27
CHTF18-217ENST00000567620 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CHTF18-217ENST00000567620 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.87■■■□□ 2.21
CHTF18-217ENST00000567620 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.78■■■□□ 2.2
CHTF18-217ENST00000567620 SMARCA4P51532 1647 aa28.2■■■□□ 2.1
CHTF18-217ENST00000567620 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CHTF18-217ENST00000567620 NCAPD3P42695 1498 aa28.16■■■□□ 2.1
CHTF18-217ENST00000567620 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.15■■■□□ 2.1
CHTF18-217ENST00000567620 SMARCA2P51531 1590 aa28.1■■■□□ 2.09
CHTF18-217ENST00000567620 MROH2BQ7Z745 1585 aa28■■■□□ 2.07
CHTF18-217ENST00000567620 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
CHTF18-217ENST00000567620 HMGXB3Q12766 1538 aa27.93■■■□□ 2.06
CHTF18-217ENST00000567620 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.86■■■□□ 2.05
CHTF18-217ENST00000567620 WIZO95785 1651 aa27.68■■■□□ 2.02
CHTF18-217ENST00000567620 ERCC6Q03468 1493 aa27.67■■■□□ 2.02
CHTF18-217ENST00000567620 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CHTF18-217ENST00000567620 NESP48681 1621 aa27.61■■■□□ 2.01
CHTF18-217ENST00000567620 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.43■■□□□ 1.98
CHTF18-217ENST00000567620 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.39■■□□□ 1.98
CHTF18-217ENST00000567620 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.36■■□□□ 1.97
CHTF18-217ENST00000567620 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CHTF18-217ENST00000567620 CUX2O14529 1486 aa27.33■■□□□ 1.97
CHTF18-217ENST00000567620 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.18■■□□□ 1.94
CHTF18-217ENST00000567620 CFTRP13569 1480 aa27.12■■□□□ 1.93
CHTF18-217ENST00000567620 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CHTF18-217ENST00000567620 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.1■■□□□ 1.93
CHTF18-217ENST00000567620 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.06■■□□□ 1.92
CHTF18-217ENST00000567620 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.05■■□□□ 1.92
CHTF18-217ENST00000567620 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.05■■□□□ 1.92
CHTF18-217ENST00000567620 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CHTF18-217ENST00000567620 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.9■■□□□ 1.9
CHTF18-217ENST00000567620 WDR62O43379 1518 aa26.89■■□□□ 1.89
CHTF18-217ENST00000567620 PRDM2Q13029 1718 aa26.76■■□□□ 1.88
CHTF18-217ENST00000567620 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CHTF18-217ENST00000567620 TOPBP1Q92547 1522 aa26.58■■□□□ 1.85
CHTF18-217ENST00000567620 ABCC8Q09428 1581 aa26.58■■□□□ 1.85
CHTF18-217ENST00000567620 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.5■■□□□ 1.83
CHTF18-217ENST00000567620 IFT140Q96RY7 1462 aa26.49■■□□□ 1.83
CHTF18-217ENST00000567620 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CHTF18-217ENST00000567620 OSCARQ8IYS5 282 aa26.34■■□□□ 1.81
CHTF18-217ENST00000567620 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CHTF18-217ENST00000567620 SOGA1O94964 1423 aa26.32■■□□□ 1.8
CHTF18-217ENST00000567620 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.28■■□□□ 1.8
CHTF18-217ENST00000567620 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.84e-7■■■■■ 39.8
CHTF18-217ENST00000567620 CUX1P39880 1505 aa26.27■■□□□ 1.8
CHTF18-217ENST00000567620 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.26■■□□□ 1.79
CHTF18-217ENST00000567620 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CHTF18-217ENST00000567620 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CHTF18-217ENST00000567620 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
CHTF18-217ENST00000567620 FBLN2P98095 1184 aa26.18■■□□□ 1.78
CHTF18-217ENST00000567620 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
CHTF18-217ENST00000567620 TRIM41Q8WV44 630 aa26.05■■□□□ 1.76
CHTF18-217ENST00000567620 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CHTF18-217ENST00000567620 WDR97A6NE52 1622 aa25.98■■□□□ 1.75
CHTF18-217ENST00000567620 GRIN2BQ13224 1484 aa25.98■■□□□ 1.75
CHTF18-217ENST00000567620 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.98■■□□□ 1.75
CHTF18-217ENST00000567620 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.96■■□□□ 1.75
CHTF18-217ENST00000567620 TOP2BQ02880 1626 aa25.96■■□□□ 1.75
CHTF18-217ENST00000567620 SYNJ1O43426 1573 aa25.95■■□□□ 1.74
CHTF18-217ENST00000567620 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.94■■□□□ 1.74
CHTF18-217ENST00000567620 CHD1O14646 1710 aa25.92■■□□□ 1.74
CHTF18-217ENST00000567620 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.92■■□□□ 1.74
CHTF18-217ENST00000567620 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CHTF18-217ENST00000567620 SYNJ2O15056 1496 aa25.82■■□□□ 1.72
CHTF18-217ENST00000567620 PBRM1Q86U86 1689 aa25.81■■□□□ 1.72
CHTF18-217ENST00000567620 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.81■■□□□ 1.72
CHTF18-217ENST00000567620 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
CHTF18-217ENST00000567620 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
CHTF18-217ENST00000567620 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
CHTF18-217ENST00000567620 ARHGEF11O15085 1522 aa25.75■■□□□ 1.71
CHTF18-217ENST00000567620 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.73■■□□□ 1.71
CHTF18-217ENST00000567620 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.65■■□□□ 1.7
CHTF18-217ENST00000567620 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.63■■□□□ 1.69
CHTF18-217ENST00000567620 GRIN2AQ12879 1464 aa25.62■■□□□ 1.69
CHTF18-217ENST00000567620 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.62■■□□□ 1.69
CHTF18-217ENST00000567620 ADAMTS12P58397 1594 aa25.61■■□□□ 1.69
CHTF18-217ENST00000567620 KIF27Q86VH2 1401 aa25.58■■□□□ 1.69
CHTF18-217ENST00000567620 ARAP1Q96P48 1450 aa25.52■■□□□ 1.68
CHTF18-217ENST00000567620 IGF1RP08069 1367 aa25.5■■□□□ 1.67
CHTF18-217ENST00000567620 NUP160Q12769 1436 aa25.47■■□□□ 1.67
CHTF18-217ENST00000567620 CEP170Q5SW79 1584 aa25.47■■□□□ 1.67
CHTF18-217ENST00000567620 JPH4Q96JJ6 628 aa25.39■■□□□ 1.66
CHTF18-217ENST00000567620 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.37■■□□□ 1.65
CHTF18-217ENST00000567620 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CHTF18-217ENST00000567620 CUL7Q14999 1698 aa25.33■■□□□ 1.65
CHTF18-217ENST00000567620 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.31■■□□□ 1.64
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