RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.42■■■□□ 2.14
PTPRU-201ENST00000345512 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRU-201ENST00000345512 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PTPRU-201ENST00000345512 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.27■■□□□ 1.8
PTPRU-201ENST00000345512 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRU-201ENST00000345512 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.88■■□□□ 1.57
PTPRU-201ENST00000345512 HRCP23327 699 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRU-201ENST00000345512 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.67■■□□□ 1.54
PTPRU-201ENST00000345512 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
PTPRU-201ENST00000345512 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRU-201ENST00000345512 TRIM41Q8WV44 630 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRU-201ENST00000345512 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PTPRU-201ENST00000345512 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
PTPRU-201ENST00000345512 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRU-201ENST00000345512 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRU-201ENST00000345512 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PTPRU-201ENST00000345512 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRU-201ENST00000345512 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRU-201ENST00000345512 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRU-201ENST00000345512 APLP2Q06481 763 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRU-201ENST00000345512 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRU-201ENST00000345512 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRU-201ENST00000345512 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PTPRU-201ENST00000345512 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRU-201ENST00000345512 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRU-201ENST00000345512 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.32■■□□□ 1.32
PTPRU-201ENST00000345512 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRU-201ENST00000345512 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PTPRU-201ENST00000345512 ABCC9O60706 1549 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRU-201ENST00000345512 SCRIBQ14160 1630 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRU-201ENST00000345512 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRU-201ENST00000345512 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-201ENST00000345512 MYT1Q01538 1121 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRU-201ENST00000345512 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRU-201ENST00000345512 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PTPRU-201ENST00000345512 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PTPRU-201ENST00000345512 ITGAEP38570 1179 aa22.8■■□□□ 1.24
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-201ENST00000345512 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRU-201ENST00000345512 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
PTPRU-201ENST00000345512 NEUROD1Q13562 356 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRU-201ENST00000345512 NEFLP07196 543 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRU-201ENST00000345512 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-201ENST00000345512 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-201ENST00000345512 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRU-201ENST00000345512 CEP162Q5TB80 1403 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRU-201ENST00000345512 MIER1Q8N108 512 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRU-201ENST00000345512 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRU-201ENST00000345512 BCANQ96GW7 911 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-201ENST00000345512 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-201ENST00000345512 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-201ENST00000345512 NACADO15069 1562 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-201ENST00000345512 CLIP1P30622 1438 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-201ENST00000345512 EEA1Q15075 1411 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-201ENST00000345512 GOLGA3Q08378 1498 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRU-201ENST00000345512 SOGA1O94964 1423 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRU-201ENST00000345512 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-201ENST00000345512 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
PTPRU-201ENST00000345512 ANP32CO43423 234 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-201ENST00000345512 P3H3Q8IVL6 736 aa22■■□□□ 1.11
PTPRU-201ENST00000345512 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRU-201ENST00000345512 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-201ENST00000345512 ABCC8Q09428 1581 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRU-201ENST00000345512 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRU-201ENST00000345512 WIZO95785 1651 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-201ENST00000345512 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRU-201ENST00000345512 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRU-201ENST00000345512 FKBP8Q14318 412 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRU-201ENST00000345512 TRIM52Q96A61 297 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRU-201ENST00000345512 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PTPRU-201ENST00000345512 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
PTPRU-201ENST00000345512 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRU-201ENST00000345512 TONSLQ96HA7 1378 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRU-201ENST00000345512 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.65■■□□□ 1.06
PTPRU-201ENST00000345512 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-201ENST00000345512 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTPRU-201ENST00000345512 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PTPRU-201ENST00000345512 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
PTPRU-201ENST00000345512 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTPRU-201ENST00000345512 ARID3CA6NKF2 412 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-201ENST00000345512 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-201ENST00000345512 KIF27Q86VH2 1401 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-201ENST00000345512 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-201ENST00000345512 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-201ENST00000345512 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PTPRU-201ENST00000345512 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-201ENST00000345512 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRU-201ENST00000345512 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRU-201ENST00000345512 SMARCA4P51532 1647 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-201ENST00000345512 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRU-201ENST00000345512 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PTPRU-201ENST00000345512 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.37■■□□□ 1.01
PTPRU-201ENST00000345512 SMARCA2P51531 1590 aa21.36■■□□□ 1.01
PTPRU-201ENST00000345512 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
PTPRU-201ENST00000345512 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.31■■□□□ 1
PTPRU-201ENST00000345512 MRS2Q9HD23 443 aa21.29■■□□□ 1
PTPRU-201ENST00000345512 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.29■■□□□ 1
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