Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-215ENST00000550873 527 ntTSL 512.72□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-204ENST00000541517 5173 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-223ENST00000552985 762 ntTSL 311.14□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-221ENST00000552642 526 ntTSL 49.18□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 TPCN1-209ENST00000547275 564 ntTSL 48.6□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 29.04□□□□□ -0.962e-7■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.242e-7■■■■□ 21.1
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TARDBPQ13148 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 SLC25A12-203ENST00000426896 911 ntTSL 27.56□□□□□ -1.23e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 SLC25A12-201ENST00000263812 2429 ntTSL 27.1□□□□□ -1.273e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.393e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 BUB1-201ENST00000302759 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.882e-10■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.042e-10■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.352e-10■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 BUB1-207ENST00000466333 2501 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.392e-10■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.257e-10■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 311.66□□□□□ -0.546e-7■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 ALDH1A2-208ENST00000558239 664 ntTSL 411.75□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 ALDH1A2-205ENST00000557967 577 ntTSL 49.87□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 ALDH1A2-212ENST00000558595 484 ntTSL 39.87□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 ALDH1A2-206ENST00000558073 581 ntTSL 48.9□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 ALDH1A2-220ENST00000560122 562 ntTSL 58.59□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 ALDH1A2-216ENST00000559297 542 ntTSL 46.46□□□□□ -1.382e-6■■■■□ 21.1
TARDBPQ13148 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.595e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.325e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.645e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)15.08■□□□□ 03e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 316.12■□□□□ 0.175e-10■■■■□ 21
TARDBPQ13148 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.14e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.324e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 POLQ-202ENST00000474243 613 ntTSL 55.52□□□□□ -1.534e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 520.9■□□□□ 0.949e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.729e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.329e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 RER1-208ENST00000493207 686 ntTSL 216.4■□□□□ 0.229e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.039e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.079e-7■■■■□ 21
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TARDBPQ13148 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 MKLN1-209ENST00000494785 2386 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.731e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 MKLN1-206ENST00000458153 2448 ntTSL 29.55□□□□□ -0.881e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.941e-7■■■■□ 21
TARDBPQ13148 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.474e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 PTK2-251ENST00000523797 405 ntTSL 322.94■■□□□ 1.264e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 UBE2D2-204ENST00000505007 1170 ntTSL 319.29■□□□□ 0.684e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 PTK2-231ENST00000521332 630 ntTSL 419.06■□□□□ 0.644e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 PTK2-254ENST00000524040 475 ntTSL 219.06■□□□□ 0.644e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 PTK2-219ENST00000520045 602 ntTSL 418.55■□□□□ 0.564e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.564e-6■■■■□ 21
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TARDBPQ13148 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.354e-6■■■■□ 21
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TARDBPQ13148 DEPDC1B-205ENST00000512078 1596 ntTSL 28.38□□□□□ -1.074e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 UBE2D2-203ENST00000398734 901 ntTSL 57.98□□□□□ -1.134e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 PTK2-205ENST00000517453 571 ntTSL 47.76□□□□□ -1.174e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 PTK2-242ENST00000523067 488 ntTSL 47.53□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 ADAM10-211ENST00000497846 647 ntTSL 47.38□□□□□ -1.234e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 PTK2-249ENST00000523679 504 ntTSL 37.19□□□□□ -1.264e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.274e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.615e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 NUDCD3-205ENST00000472246 570 ntTSL 410.06□□□□□ -0.85e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 NUDCD3-203ENST00000460110 3641 ntTSL 1 (best)8.82□□□□□ -15e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 NUDCD3-204ENST00000464812 811 ntTSL 58.53□□□□□ -1.045e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 KDM6A-207ENST00000475233 612 ntTSL 518.5■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 21
TARDBPQ13148 TLK1-203ENST00000409443 2783 ntTSL 215.68■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 TLK1-201ENST00000359766 4321 ntTSL 510.17□□□□□ -0.781e-6■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.691e-6■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 NRSN2-204ENST00000492242 846 ntTSL 220.43■□□□□ 0.865e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.265e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 NRSN2-208ENST00000609179 578 ntTSL 315.27■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 NRSN2-209ENST00000609504 582 ntTSL 314.56□□□□□ -0.085e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.135e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 NRSN2-203ENST00000470439 697 ntTSL 212.22□□□□□ -0.455e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.465e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.333e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.159e-7■■■■□ 20.9
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