Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.274e-13■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 417.18■□□□□ 0.349e-10■■■□□ 17.5
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ILF3Q12906 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-6■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 ROBO1-204ENST00000467549 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-6■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.56e-11■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.556e-11■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.596e-11■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 SPC24-202ENST00000585486 699 ntTSL 213.02□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 AMBRA1-201ENST00000314845 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.58e-7■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.558e-7■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 AMBRA1-211ENST00000533727 4817 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.598e-7■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 AMBRA1-206ENST00000528950 4102 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.088e-7■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 RSPRY1-201ENST00000394420 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-6■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 HADHA-201ENST00000380649 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.833e-6■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.194e-47■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.713e-7■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 PAN3-204ENST00000503791 2443 ntTSL 221.87■■□□□ 1.092e-13■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.522e-13■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.32e-6■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.262e-9■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.052e-9■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.222e-9■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.242e-9■■■□□ 17.4
ILF3Q12906 ZMYM4-203ENST00000457946 6003 ntTSL 55.63□□□□□ -1.512e-9■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.652e-9■■■□□ 17.4
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ILF3Q12906 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.956e-8■■■□□ 17.3
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ILF3Q12906 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.081e-6■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.211e-6■■■□□ 17.3
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ILF3Q12906 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-7■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 GANAB-211ENST00000532402 3718 ntTSL 1 (best)9.43□□□□□ -0.91e-7■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.931e-7■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.233e-9■■■□□ 17.3
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ILF3Q12906 DDX3X-206ENST00000542215 1592 ntTSL 218.05■□□□□ 0.481e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-208ENST00000611546 442 ntTSL 516.77■□□□□ 0.281e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-213ENST00000622198 409 ntTSL 416.77■□□□□ 0.281e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.31e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.671e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.81e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-216ENST00000626301 3013 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.851e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-218ENST00000629785 3457 ntTSL 59.22□□□□□ -0.931e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-220ENST00000630370 3120 ntTSL 59.18□□□□□ -0.941e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-219ENST00000630255 3289 ntTSL 59.07□□□□□ -0.961e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-221ENST00000630858 3181 ntTSL 59.02□□□□□ -0.971e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-204ENST00000478993 3397 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -11e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-211ENST00000615742 485 ntTSL 48.25□□□□□ -1.091e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.091e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 DDX3X-222ENST00000631641 583 ntTSL 38.25□□□□□ -1.091e-8■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.719e-9■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.649e-9■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.499e-9■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.559e-9■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.75e-7■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 IMMP2L-209ENST00000489381 856 ntTSL 54.35□□□□□ -1.715e-7■■■□□ 17.3
ILF3Q12906 E4F1-202ENST00000562589 817 ntTSL 524.92■■□□□ 1.581e-6■■■□□ 17.3
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