RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601252.1

TIMM50-215, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 1,737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-215ENST00000601252 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.36■■■□□ 2.61
TIMM50-215ENST00000601252 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.34■■□□□ 1.97
TIMM50-215ENST00000601252 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
TIMM50-215ENST00000601252 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26■■□□□ 1.75
TIMM50-215ENST00000601252 ABCC9O60706 1549 aa25.74■■□□□ 1.71
TIMM50-215ENST00000601252 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.69■■□□□ 1.7
TIMM50-215ENST00000601252 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.57■■□□□ 1.68
TIMM50-215ENST00000601252 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.57■■□□□ 1.68
TIMM50-215ENST00000601252 NACADO15069 1562 aa25.29■■□□□ 1.64
TIMM50-215ENST00000601252 SCRIBQ14160 1630 aa25.07■■□□□ 1.6
TIMM50-215ENST00000601252 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.99■■□□□ 1.59
TIMM50-215ENST00000601252 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TIMM50-215ENST00000601252 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.61■■□□□ 1.53
TIMM50-215ENST00000601252 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TIMM50-215ENST00000601252 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.27■■□□□ 1.48
TIMM50-215ENST00000601252 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TIMM50-215ENST00000601252 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.21■■□□□ 1.47
TIMM50-215ENST00000601252 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.2■■□□□ 1.46
TIMM50-215ENST00000601252 SMARCA4P51532 1647 aa24.1■■□□□ 1.45
TIMM50-215ENST00000601252 WIZO95785 1651 aa24.09■■□□□ 1.45
TIMM50-215ENST00000601252 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
TIMM50-215ENST00000601252 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.01■■□□□ 1.43
TIMM50-215ENST00000601252 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
TIMM50-215ENST00000601252 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM50-215ENST00000601252 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.72■■□□□ 1.39
TIMM50-215ENST00000601252 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
TIMM50-215ENST00000601252 SMARCA2P51531 1590 aa23.65■■□□□ 1.38
TIMM50-215ENST00000601252 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.54■■□□□ 1.36
TIMM50-215ENST00000601252 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMM50-215ENST00000601252 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TIMM50-215ENST00000601252 TRIM41Q8WV44 630 aa23.39■■□□□ 1.34
TIMM50-215ENST00000601252 HMGXB3Q12766 1538 aa23.36■■□□□ 1.33
TIMM50-215ENST00000601252 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.34■■□□□ 1.33
TIMM50-215ENST00000601252 NCAPD3P42695 1498 aa23.26■■□□□ 1.31
TIMM50-215ENST00000601252 ABCC8Q09428 1581 aa23.19■■□□□ 1.3
TIMM50-215ENST00000601252 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.04■■□□□ 1.28
TIMM50-215ENST00000601252 PRDM2Q13029 1718 aa23.01■■□□□ 1.27
TIMM50-215ENST00000601252 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
TIMM50-215ENST00000601252 SYNJ1O43426 1573 aa22.93■■□□□ 1.26
TIMM50-215ENST00000601252 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
TIMM50-215ENST00000601252 EEA1Q15075 1411 aa22.9■■□□□ 1.26
TIMM50-215ENST00000601252 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.86■■□□□ 1.25
TIMM50-215ENST00000601252 CFTRP13569 1480 aa22.85■■□□□ 1.25
TIMM50-215ENST00000601252 TOP2BQ02880 1626 aa22.84■■□□□ 1.25
TIMM50-215ENST00000601252 SOGA1O94964 1423 aa22.76■■□□□ 1.23
TIMM50-215ENST00000601252 HRCP23327 699 aa22.67■■□□□ 1.22
TIMM50-215ENST00000601252 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.66■■□□□ 1.22
TIMM50-215ENST00000601252 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.65■■□□□ 1.22
TIMM50-215ENST00000601252 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.65■■□□□ 1.22
TIMM50-215ENST00000601252 KIF21BO75037 1637 aa22.65■■□□□ 1.22
TIMM50-215ENST00000601252 CUX1P39880 1505 aa22.64■■□□□ 1.22
TIMM50-215ENST00000601252 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.6■■□□□ 1.21
TIMM50-215ENST00000601252 GOLGA3Q08378 1498 aa22.59■■□□□ 1.21
TIMM50-215ENST00000601252 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TIMM50-215ENST00000601252 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.55■■□□□ 1.2
TIMM50-215ENST00000601252 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.54■■□□□ 1.2
TIMM50-215ENST00000601252 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.53■■□□□ 1.2
TIMM50-215ENST00000601252 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.5■■□□□ 1.19
TIMM50-215ENST00000601252 CEP162Q5TB80 1403 aa22.45■■□□□ 1.18
TIMM50-215ENST00000601252 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.45■■□□□ 1.18
TIMM50-215ENST00000601252 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.41■■□□□ 1.18
TIMM50-215ENST00000601252 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.38■■□□□ 1.17
TIMM50-215ENST00000601252 KIF27Q86VH2 1401 aa22.38■■□□□ 1.17
TIMM50-215ENST00000601252 NESP48681 1621 aa22.36■■□□□ 1.17
TIMM50-215ENST00000601252 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.33■■□□□ 1.17
TIMM50-215ENST00000601252 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TIMM50-215ENST00000601252 PRXQ9BXM0 1461 aa22.32■■□□□ 1.16
TIMM50-215ENST00000601252 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.32■■□□□ 1.16
TIMM50-215ENST00000601252 TOPBP1Q92547 1522 aa22.27■■□□□ 1.15
TIMM50-215ENST00000601252 CUX2O14529 1486 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-215ENST00000601252 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-215ENST00000601252 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMM50-215ENST00000601252 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TIMM50-215ENST00000601252 WDR97A6NE52 1622 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-215ENST00000601252 CLIP1P30622 1438 aa22.19■■□□□ 1.14
TIMM50-215ENST00000601252 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TIMM50-215ENST00000601252 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.17■■□□□ 1.14
TIMM50-215ENST00000601252 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TIMM50-215ENST00000601252 CUL7Q14999 1698 aa22.08■■□□□ 1.12
TIMM50-215ENST00000601252 IGF1RP08069 1367 aa22.08■■□□□ 1.12
TIMM50-215ENST00000601252 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.08■■□□□ 1.12
TIMM50-215ENST00000601252 ERCC6Q03468 1493 aa22.07■■□□□ 1.12
TIMM50-215ENST00000601252 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMM50-215ENST00000601252 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-215ENST00000601252 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.03■■□□□ 1.12
TIMM50-215ENST00000601252 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.99■■□□□ 1.11
TIMM50-215ENST00000601252 ARAP1Q96P48 1450 aa21.95■■□□□ 1.1
TIMM50-215ENST00000601252 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.95■■□□□ 1.1
TIMM50-215ENST00000601252 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
TIMM50-215ENST00000601252 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.93■■□□□ 1.1
TIMM50-215ENST00000601252 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TIMM50-215ENST00000601252 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.88■■□□□ 1.09
TIMM50-215ENST00000601252 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.87■■□□□ 1.09
TIMM50-215ENST00000601252 PBRM1Q86U86 1689 aa21.87■■□□□ 1.09
TIMM50-215ENST00000601252 WDR62O43379 1518 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-215ENST00000601252 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM50-215ENST00000601252 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TIMM50-215ENST00000601252 APLP2Q06481 763 aa21.79■■□□□ 1.08
TIMM50-215ENST00000601252 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.78■■□□□ 1.08
TIMM50-215ENST00000601252 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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