RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447318.6

ARF3-202, Transcript of ADP ribosylation factor 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ARF3, Length 1,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3-202ENST00000447318 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.67■■■■■ 5.86
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ARF3-202ENST00000447318 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.91■■■■■ 4.62
ARF3-202ENST00000447318 NACADO15069 1562 aa43.71■■■■■ 4.59
ARF3-202ENST00000447318 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.33■■■■■ 4.53
ARF3-202ENST00000447318 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.3■■■■■ 4.52
ARF3-202ENST00000447318 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.88■■■■■ 4.45
ARF3-202ENST00000447318 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
ARF3-202ENST00000447318 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.86■■■■■ 4.45
ARF3-202ENST00000447318 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.8■■■■■ 4.44
ARF3-202ENST00000447318 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.76■■■■■ 4.44
ARF3-202ENST00000447318 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.61■■■■■ 4.41
ARF3-202ENST00000447318 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.2■■■■■ 4.35
ARF3-202ENST00000447318 SCRIBQ14160 1630 aa42.04■■■■■ 4.32
ARF3-202ENST00000447318 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.53■■■■■ 4.24
ARF3-202ENST00000447318 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
ARF3-202ENST00000447318 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.38■■■■■ 4.21
ARF3-202ENST00000447318 NCAPD3P42695 1498 aa40.38■■■■■ 4.05
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ARF3-202ENST00000447318 SMARCA4P51532 1647 aa40.22■■■■■ 4.03
ARF3-202ENST00000447318 SMARCA2P51531 1590 aa40.14■■■■■ 4.02
ARF3-202ENST00000447318 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
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ARF3-202ENST00000447318 ERCC6Q03468 1493 aa39.62■■■■□ 3.93
ARF3-202ENST00000447318 CUX2O14529 1486 aa39.58■■■■□ 3.93
ARF3-202ENST00000447318 NESP48681 1621 aa39.51■■■■□ 3.91
ARF3-202ENST00000447318 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.38■■■■□ 3.9
ARF3-202ENST00000447318 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.27■■■■□ 3.88
ARF3-202ENST00000447318 WIZO95785 1651 aa39.26■■■■□ 3.88
ARF3-202ENST00000447318 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.14■■■■□ 3.86
ARF3-202ENST00000447318 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.11■■■■□ 3.85
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ARF3-202ENST00000447318 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.01■■■■□ 3.84
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ARF3-202ENST00000447318 CFTRP13569 1480 aa38.74■■■■□ 3.79
ARF3-202ENST00000447318 WDR62O43379 1518 aa38.68■■■■□ 3.78
ARF3-202ENST00000447318 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.64■■■■□ 3.78
ARF3-202ENST00000447318 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.62■■■■□ 3.77
ARF3-202ENST00000447318 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.4■■■■□ 3.74
ARF3-202ENST00000447318 PRDM2Q13029 1718 aa38.32■■■■□ 3.73
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ARF3-202ENST00000447318 ABCC8Q09428 1581 aa37.95■■■■□ 3.67
ARF3-202ENST00000447318 TOPBP1Q92547 1522 aa37.92■■■■□ 3.66
ARF3-202ENST00000447318 IFT140Q96RY7 1462 aa37.9■■■■□ 3.66
ARF3-202ENST00000447318 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.82■■■■□ 3.65
ARF3-202ENST00000447318 OSCARQ8IYS5 282 aa37.8■■■■□ 3.64
ARF3-202ENST00000447318 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
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ARF3-202ENST00000447318 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.44■■■■□ 3.58
ARF3-202ENST00000447318 SOGA1O94964 1423 aa37.39■■■■□ 3.58
ARF3-202ENST00000447318 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
ARF3-202ENST00000447318 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.36■■■■□ 3.57
ARF3-202ENST00000447318 CUX1P39880 1505 aa37.35■■■■□ 3.57
ARF3-202ENST00000447318 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.33■■■■□ 3.57
ARF3-202ENST00000447318 WDR97A6NE52 1622 aa37.31■■■■□ 3.56
ARF3-202ENST00000447318 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
ARF3-202ENST00000447318 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.21■■■■□ 3.55
ARF3-202ENST00000447318 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.21■■■■□ 3.55
ARF3-202ENST00000447318 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.21■■■■□ 3.55
ARF3-202ENST00000447318 CHD1O14646 1710 aa37.2■■■■□ 3.55
ARF3-202ENST00000447318 ARHGEF11O15085 1522 aa37.15■■■■□ 3.54
ARF3-202ENST00000447318 FBLN2P98095 1184 aa37.08■■■■□ 3.53
ARF3-202ENST00000447318 GRIN2BQ13224 1484 aa37.06■■■■□ 3.52
ARF3-202ENST00000447318 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.06■■■■□ 3.52
ARF3-202ENST00000447318 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
ARF3-202ENST00000447318 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.99■■■■□ 3.51
ARF3-202ENST00000447318 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.94■■■■□ 3.5
ARF3-202ENST00000447318 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
ARF3-202ENST00000447318 SYNJ2O15056 1496 aa36.91■■■■□ 3.5
ARF3-202ENST00000447318 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.88■■■■□ 3.49
ARF3-202ENST00000447318 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.88■■■■□ 3.49
ARF3-202ENST00000447318 PBRM1Q86U86 1689 aa36.86■■■■□ 3.49
ARF3-202ENST00000447318 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.85■■■■□ 3.49
ARF3-202ENST00000447318 TOP2BQ02880 1626 aa36.85■■■■□ 3.49
ARF3-202ENST00000447318 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.85■■■■□ 3.49
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ARF3-202ENST00000447318 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.82■■■■□ 3.48
ARF3-202ENST00000447318 ARAP1Q96P48 1450 aa36.78■■■■□ 3.48
ARF3-202ENST00000447318 GRIN2AQ12879 1464 aa36.56■■■■□ 3.44
ARF3-202ENST00000447318 ADAMTS12P58397 1594 aa36.55■■■■□ 3.44
ARF3-202ENST00000447318 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.54■■■■□ 3.44
ARF3-202ENST00000447318 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.51■■■■□ 3.44
ARF3-202ENST00000447318 NUP160Q12769 1436 aa36.48■■■■□ 3.43
ARF3-202ENST00000447318 CEP170Q5SW79 1584 aa36.39■■■■□ 3.42
ARF3-202ENST00000447318 SHROOM2Q13796 1616 aa36.28■■■■□ 3.4
ARF3-202ENST00000447318 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
ARF3-202ENST00000447318 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.22■■■■□ 3.39
ARF3-202ENST00000447318 KIF27Q86VH2 1401 aa36.14■■■■□ 3.38
ARF3-202ENST00000447318 IGF1RP08069 1367 aa36.13■■■■□ 3.37
ARF3-202ENST00000447318 JPH4Q96JJ6 628 aa36.08■■■■□ 3.37
ARF3-202ENST00000447318 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
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