RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.43■■■■□ 3.74
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SPC24-201ENST00000423327 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.4■■■□□ 2.78
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SPC24-201ENST00000423327 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.07■■■□□ 2.72
SPC24-201ENST00000423327 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.01■■■□□ 2.72
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SPC24-201ENST00000423327 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.77■■■□□ 2.68
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SPC24-201ENST00000423327 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.63■■■□□ 2.49
SPC24-201ENST00000423327 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.44■■■□□ 2.46
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SPC24-201ENST00000423327 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
SPC24-201ENST00000423327 SMARCA2P51531 1590 aa29.7■■■□□ 2.35
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SPC24-201ENST00000423327 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.63■■■□□ 2.33
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SPC24-201ENST00000423327 WIZO95785 1651 aa29.32■■■□□ 2.28
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SPC24-201ENST00000423327 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
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SPC24-201ENST00000423327 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.06■■■□□ 2.24
SPC24-201ENST00000423327 CUX2O14529 1486 aa28.97■■■□□ 2.23
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SPC24-201ENST00000423327 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.9■■■□□ 2.22
SPC24-201ENST00000423327 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.89■■■□□ 2.22
SPC24-201ENST00000423327 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.82■■■□□ 2.2
SPC24-201ENST00000423327 CFTRP13569 1480 aa28.71■■■□□ 2.19
SPC24-201ENST00000423327 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.61■■■□□ 2.17
SPC24-201ENST00000423327 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.6■■■□□ 2.17
SPC24-201ENST00000423327 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.59■■■□□ 2.17
SPC24-201ENST00000423327 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.57■■■□□ 2.16
SPC24-201ENST00000423327 WDR62O43379 1518 aa28.57■■■□□ 2.16
SPC24-201ENST00000423327 PRDM2Q13029 1718 aa28.49■■■□□ 2.15
SPC24-201ENST00000423327 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.41■■■□□ 2.14
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SPC24-201ENST00000423327 TOPBP1Q92547 1522 aa28.13■■■□□ 2.09
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SPC24-201ENST00000423327 IFT140Q96RY7 1462 aa27.98■■■□□ 2.07
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SPC24-201ENST00000423327 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.76■■■□□ 2.04
SPC24-201ENST00000423327 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.76■■■□□ 2.03
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SPC24-201ENST00000423327 WDR97A6NE52 1622 aa27.62■■■□□ 2.01
SPC24-201ENST00000423327 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
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SPC24-201ENST00000423327 SYNJ1O43426 1573 aa27.51■■□□□ 1.99
SPC24-201ENST00000423327 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.5■■□□□ 1.99
SPC24-201ENST00000423327 TOP2BQ02880 1626 aa27.49■■□□□ 1.99
SPC24-201ENST00000423327 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
SPC24-201ENST00000423327 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.46■■□□□ 1.99
SPC24-201ENST00000423327 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.46■■□□□ 1.99
SPC24-201ENST00000423327 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.43■■□□□ 1.98
SPC24-201ENST00000423327 PBRM1Q86U86 1689 aa27.41■■□□□ 1.98
SPC24-201ENST00000423327 GRIN2BQ13224 1484 aa27.41■■□□□ 1.98
SPC24-201ENST00000423327 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.38■■□□□ 1.97
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SPC24-201ENST00000423327 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.37■■□□□ 1.97
SPC24-201ENST00000423327 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.37■■□□□ 1.97
SPC24-201ENST00000423327 ARHGEF11O15085 1522 aa27.32■■□□□ 1.96
SPC24-201ENST00000423327 FBLN2P98095 1184 aa27.32■■□□□ 1.96
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SPC24-201ENST00000423327 SYNJ2O15056 1496 aa27.28■■□□□ 1.96
SPC24-201ENST00000423327 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.25■■□□□ 1.95
SPC24-201ENST00000423327 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
SPC24-201ENST00000423327 ADAMTS12P58397 1594 aa27.18■■□□□ 1.94
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SPC24-201ENST00000423327 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.11■■□□□ 1.93
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SPC24-201ENST00000423327 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.04■■□□□ 1.92
SPC24-201ENST00000423327 CEP170Q5SW79 1584 aa27.03■■□□□ 1.92
SPC24-201ENST00000423327 NUP160Q12769 1436 aa27■■□□□ 1.91
SPC24-201ENST00000423327 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.97■■□□□ 1.91
SPC24-201ENST00000423327 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.88■■□□□ 1.89
SPC24-201ENST00000423327 KIF27Q86VH2 1401 aa26.87■■□□□ 1.89
SPC24-201ENST00000423327 SHROOM2Q13796 1616 aa26.87■■□□□ 1.89
SPC24-201ENST00000423327 IGF1RP08069 1367 aa26.85■■□□□ 1.89
SPC24-201ENST00000423327 CUL7Q14999 1698 aa26.81■■□□□ 1.88
SPC24-201ENST00000423327 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.8■■□□□ 1.88
SPC24-201ENST00000423327 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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