Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AMFRQ9UKV5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AMFRQ9UKV5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AMFRQ9UKV5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AMFRQ9UKV5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AMFRQ9UKV5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
AMFRQ9UKV5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AMFRQ9UKV5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AMFRQ9UKV5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
AMFRQ9UKV5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
AMFRQ9UKV5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
AMFRQ9UKV5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AMFRQ9UKV5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AMFRQ9UKV5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
AMFRQ9UKV5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms