Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV7

ZIM2, Zinc finger imprinted 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM2Q9NZV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZIM2Q9NZV7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM2Q9NZV7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM2Q9NZV7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZIM2Q9NZV7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIM2Q9NZV7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIM2Q9NZV7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZIM2Q9NZV7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZIM2Q9NZV7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZIM2Q9NZV7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZIM2Q9NZV7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZIM2Q9NZV7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms