Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS4

TMEM59, Transmembrane protein 59, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM59Q9BXS4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM59Q9BXS4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM59Q9BXS4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM59Q9BXS4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM59Q9BXS4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM59Q9BXS4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM59Q9BXS4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM59Q9BXS4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM59Q9BXS4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms