Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms