Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TM2D1Q9BX74 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TM2D1Q9BX74 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TM2D1Q9BX74 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TM2D1Q9BX74 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TM2D1Q9BX74 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms