Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP58Q9BVL2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP58Q9BVL2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NUP58Q9BVL2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NUP58Q9BVL2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NUP58Q9BVL2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms