Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NUP58Q9BVL2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NUP58Q9BVL2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP58Q9BVL2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
NUP58Q9BVL2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
NUP58Q9BVL2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NUP58Q9BVL2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NUP58Q9BVL2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NUP58Q9BVL2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP58Q9BVL2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP58Q9BVL2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NUP58Q9BVL2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NUP58Q9BVL2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NUP58Q9BVL2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NUP58Q9BVL2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP58Q9BVL2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP58Q9BVL2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NUP58Q9BVL2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NUP58Q9BVL2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NUP58Q9BVL2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NUP58Q9BVL2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NUP58Q9BVL2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NUP58Q9BVL2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NUP58Q9BVL2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP58Q9BVL2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP58Q9BVL2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NUP58Q9BVL2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NUP58Q9BVL2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUP58Q9BVL2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NUP58Q9BVL2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NUP58Q9BVL2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NUP58Q9BVL2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NUP58Q9BVL2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NUP58Q9BVL2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
NUP58Q9BVL2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP58Q9BVL2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP58Q9BVL2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NUP58Q9BVL2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NUP58Q9BVL2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NUP58Q9BVL2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NUP58Q9BVL2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NUP58Q9BVL2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NUP58Q9BVL2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NUP58Q9BVL2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NUP58Q9BVL2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NUP58Q9BVL2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NUP58Q9BVL2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NUP58Q9BVL2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NUP58Q9BVL2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP58Q9BVL2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NUP58Q9BVL2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NUP58Q9BVL2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NUP58Q9BVL2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NUP58Q9BVL2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NUP58Q9BVL2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NUP58Q9BVL2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NUP58Q9BVL2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NUP58Q9BVL2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
NUP58Q9BVL2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
NUP58Q9BVL2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NUP58Q9BVL2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NUP58Q9BVL2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP58Q9BVL2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP58Q9BVL2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP58Q9BVL2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP58Q9BVL2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUP58Q9BVL2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUP58Q9BVL2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NUP58Q9BVL2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUP58Q9BVL2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUP58Q9BVL2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUP58Q9BVL2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NUP58Q9BVL2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUP58Q9BVL2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUP58Q9BVL2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUP58Q9BVL2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP58Q9BVL2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP58Q9BVL2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP58Q9BVL2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP58Q9BVL2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP58Q9BVL2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP58Q9BVL2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
NUP58Q9BVL2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP58Q9BVL2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NUP58Q9BVL2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP58Q9BVL2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NUP58Q9BVL2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NUP58Q9BVL2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP58Q9BVL2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NUP58Q9BVL2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NUP58Q9BVL2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP58Q9BVL2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NUP58Q9BVL2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP58Q9BVL2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NUP58Q9BVL2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NUP58Q9BVL2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NUP58Q9BVL2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NUP58Q9BVL2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NUP58Q9BVL2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NUP58Q9BVL2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms