Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRRC1Q96M27 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRRC1Q96M27 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PRRC1Q96M27 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRRC1Q96M27 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRRC1Q96M27 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 736.4 ms