Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE00

TMEM104, Transmembrane protein 104, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM104Q8NE00 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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TMEM104Q8NE00 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM104Q8NE00 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM104Q8NE00 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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TMEM104Q8NE00 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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TMEM104Q8NE00 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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TMEM104Q8NE00 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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TMEM104Q8NE00 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM104Q8NE00 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM104Q8NE00 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM104Q8NE00 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM104Q8NE00 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM104Q8NE00 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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