Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDP4

KLHL17, Kelch-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL17Q6TDP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KLHL17Q6TDP4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL17Q6TDP4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL17Q6TDP4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL17Q6TDP4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms