Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL13AP3Q6NVV1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPL13AP3Q6NVV1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPL13AP3Q6NVV1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPL13AP3Q6NVV1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPL13AP3Q6NVV1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms