Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VMACQ2NL98 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VMACQ2NL98 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VMACQ2NL98 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VMACQ2NL98 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VMACQ2NL98 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms