Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPS6KA1Q15418 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPS6KA1Q15418 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KA1Q15418 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPS6KA1Q15418 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPS6KA1Q15418 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPS6KA1Q15418 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
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