Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 517.84■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-208ENST00000476309 748 ntTSL 316.21■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 RNF40-212ENST00000602784 991 ntTSL 315.39■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-214ENST00000514733 919 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 INPPL1-215ENST00000544806 547 ntTSL 413.98□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-202ENST00000394065 3755 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-207ENST00000471765 717 ntTSL 39.09□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 47.2
PCBP1Q15365 HOXB8-202ENST00000498634 502 ntTSL 310.9□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 47.2
PCBP1Q15365 APOC4-APOC2-201ENST00000585685 1829 ntTSL 517.28■□□□□ 0.362e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.282e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC4-APOC2-202ENST00000589057 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.242e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.292e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 57.4□□□□□ -1.225e-13■■■■■ 46.8
PCBP1Q15365 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.635e-13■■■■■ 46.8
PCBP1Q15365 SORBS3-215ENST00000522721 601 ntTSL 425.84■■□□□ 1.736e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-202ENST00000517500 1228 ntTSL 223.7■■□□□ 1.386e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-203ENST00000392628 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.41■■□□□ 1.346e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SDC1-205ENST00000447124 591 ntTSL 423.04■■□□□ 1.286e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-218ENST00000523740 983 ntTSL 323.02■■□□□ 1.286e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-208ENST00000581590 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.78■■□□□ 1.246e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.26e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.096e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-212ENST00000521787 561 ntTSL 421.74■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.966e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-214ENST00000522315 563 ntTSL 419.91■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-211ENST00000521554 858 ntTSL 217.33■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-207ENST00000519453 560 ntTSL 417.31■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 WNK2-208ENST00000453718 1937 ntTSL 516.86■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-219ENST00000523900 670 ntTSL 315.96■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-206ENST00000471877 1766 ntTSL 215.67■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-208ENST00000483478 475 ntTSL 313.94□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ANPEP-207ENST00000560028 582 ntTSL 313.3□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-210ENST00000495408 569 ntTSL 410.93□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 C19orf53-203ENST00000588841 499 ntTSL 29.23□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 C19orf53-204ENST00000588858 666 ntTSL 38.98□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-209ENST00000490092 501 ntTSL 48.11□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 C19orf53-201ENST00000221576 504 ntTSL 26.81□□□□□ -1.326e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.996e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.546e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.376e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.326e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 315.07■□□□□ 06e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 210.79□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 38.36□□□□□ -1.076e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 YTHDF2-203ENST00000474884 864 ntTSL 519.72■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 YTHDF2-207ENST00000496288 879 ntTSL 219.39■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 YTHDF2-206ENST00000478283 2594 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.397e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.633e-12■■■■■ 46.4
PCBP1Q15365 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.215e-6■■■■■ 46
PCBP1Q15365 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.764e-50■■■■■ 45.9
PCBP1Q15365 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.574e-50■■■■■ 45.9
PCBP1Q15365 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-50■■■■■ 45.9
PCBP1Q15365 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.24e-50■■■■■ 45.9
PCBP1Q15365 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-50■■■■■ 45.9
PCBP1Q15365 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.421e-13■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 CLPTM1-205ENST00000586915 775 ntTSL 219.11■□□□□ 0.651e-13■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.181e-13■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-13■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -11e-87■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.661e-13■■■■■ 45.7
PCBP1Q15365 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-13■■■■■ 45.7
PCBP1Q15365 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-13■■■■■ 45.7
PCBP1Q15365 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-13■■■■■ 45.7
PCBP1Q15365 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.721e-13■■■■■ 45.7
PCBP1Q15365 TNRC18-208ENST00000455076 577 ntTSL 222.72■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 TNRC18-210ENST00000497663 588 ntTSL 216.72■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 CPNE1-228ENST00000498814 550 ntTSL 317.22■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 CPNE1-209ENST00000415920 731 ntTSL 514.87□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 CPNE1-225ENST00000483495 1853 ntTSL 514.14□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 45.6
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 274.6 ms