Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 517.84■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-208ENST00000476309 748 ntTSL 316.21■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 RNF40-212ENST00000602784 991 ntTSL 315.39■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-214ENST00000514733 919 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 INPPL1-215ENST00000544806 547 ntTSL 413.98□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 KLC2-202ENST00000394065 3755 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 AGTRAP-207ENST00000471765 717 ntTSL 39.09□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 47.3
PCBP1Q15365 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 47.2
PCBP1Q15365 HOXB8-202ENST00000498634 502 ntTSL 310.9□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 47.2
PCBP1Q15365 APOC4-APOC2-201ENST00000585685 1829 ntTSL 517.28■□□□□ 0.362e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.282e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC4-APOC2-202ENST00000589057 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.442e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.242e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.292e-28■■■■■ 47
PCBP1Q15365 USP34-204ENST00000453133 1409 ntTSL 57.4□□□□□ -1.225e-13■■■■■ 46.8
PCBP1Q15365 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.635e-13■■■■■ 46.8
PCBP1Q15365 SORBS3-215ENST00000522721 601 ntTSL 425.84■■□□□ 1.736e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-202ENST00000517500 1228 ntTSL 223.7■■□□□ 1.386e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-203ENST00000392628 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.41■■□□□ 1.346e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SDC1-205ENST00000447124 591 ntTSL 423.04■■□□□ 1.286e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-218ENST00000523740 983 ntTSL 323.02■■□□□ 1.286e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-208ENST00000581590 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.78■■□□□ 1.246e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.26e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.096e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-212ENST00000521787 561 ntTSL 421.74■■□□□ 1.076e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.966e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-214ENST00000522315 563 ntTSL 419.91■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-211ENST00000521554 858 ntTSL 217.33■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-207ENST00000519453 560 ntTSL 417.31■□□□□ 0.366e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 WNK2-208ENST00000453718 1937 ntTSL 516.86■□□□□ 0.296e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 SORBS3-219ENST00000523900 670 ntTSL 315.96■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.116e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-206ENST00000471877 1766 ntTSL 215.67■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-208ENST00000483478 475 ntTSL 313.94□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ANPEP-207ENST00000560028 582 ntTSL 313.3□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-210ENST00000495408 569 ntTSL 410.93□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 C19orf53-203ENST00000588841 499 ntTSL 29.23□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 C19orf53-204ENST00000588858 666 ntTSL 38.98□□□□□ -0.976e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 ATP6V0E2-209ENST00000490092 501 ntTSL 48.11□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 C19orf53-201ENST00000221576 504 ntTSL 26.81□□□□□ -1.326e-7■■■■■ 46.7
PCBP1Q15365 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.996e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.546e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.376e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.326e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 315.07■□□□□ 06e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.056e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 210.79□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 38.36□□□□□ -1.076e-8■■■■■ 46.6
PCBP1Q15365 YTHDF2-203ENST00000474884 864 ntTSL 519.72■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 YTHDF2-207ENST00000496288 879 ntTSL 219.39■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 YTHDF2-206ENST00000478283 2594 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.397e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 46.5
PCBP1Q15365 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.633e-12■■■■■ 46.4
PCBP1Q15365 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.215e-6■■■■■ 46
PCBP1Q15365 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.764e-50■■■■■ 45.9
PCBP1Q15365 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.574e-50■■■■■ 45.9
PCBP1Q15365 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-50■■■■■ 45.9
PCBP1Q15365 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.24e-50■■■■■ 45.9
PCBP1Q15365 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.024e-50■■■■■ 45.9
PCBP1Q15365 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.421e-13■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 CLPTM1-205ENST00000586915 775 ntTSL 219.11■□□□□ 0.651e-13■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.181e-13■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.161e-13■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -11e-87■■■■■ 45.8
PCBP1Q15365 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.661e-13■■■■■ 45.7
PCBP1Q15365 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-13■■■■■ 45.7
PCBP1Q15365 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-13■■■■■ 45.7
PCBP1Q15365 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-13■■■■■ 45.7
PCBP1Q15365 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.721e-13■■■■■ 45.7
PCBP1Q15365 TNRC18-208ENST00000455076 577 ntTSL 222.72■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 TNRC18-210ENST00000497663 588 ntTSL 216.72■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 CPNE1-228ENST00000498814 550 ntTSL 317.22■□□□□ 0.351e-8■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 CPNE1-209ENST00000415920 731 ntTSL 514.87□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 CPNE1-225ENST00000483495 1853 ntTSL 514.14□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 45.6
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