RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.53■■■■□ 3.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.62■■■□□ 2.49
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.57■■■□□ 2.32
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.36■■■□□ 2.29
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.07■■■□□ 2.24
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.7■■■□□ 2.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCRIBQ14160 1630 aa28.3■■■□□ 2.12
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NACADO15069 1562 aa28.3■■■□□ 2.12
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCC9O60706 1549 aa28.27■■■□□ 2.12
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.02■■■□□ 2.08
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.88■■■□□ 2.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.57■■■□□ 2
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.51■■□□□ 1.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.5■■□□□ 1.99
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WIZO95785 1651 aa27.37■■□□□ 1.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMARCA4P51532 1647 aa27.17■■□□□ 1.94
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.08■■□□□ 1.93
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM41Q8WV44 630 aa27.02■■□□□ 1.92
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27■■□□□ 1.91
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SMARCA2P51531 1590 aa26.84■■□□□ 1.89
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.8■■□□□ 1.88
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.6■■□□□ 1.85
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCC8Q09428 1581 aa26.52■■□□□ 1.84
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.5■■□□□ 1.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HRCP23327 699 aa26.48■■□□□ 1.83
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EEA1Q15075 1411 aa26.22■■□□□ 1.79
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.18■■□□□ 1.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HMGXB3Q12766 1538 aa26.16■■□□□ 1.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SOGA1O94964 1423 aa26.16■■□□□ 1.78
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCAPD3P42695 1498 aa26.12■■□□□ 1.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SYNJ1O43426 1573 aa26.11■■□□□ 1.77
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.04■■□□□ 1.76
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.01■■□□□ 1.75
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.98■■□□□ 1.75
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TOP2BQ02880 1626 aa25.93■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEP162Q5TB80 1403 aa25.92■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA3Q08378 1498 aa25.92■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.91■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF21BO75037 1637 aa25.89■■□□□ 1.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.83■■□□□ 1.73
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRDM2Q13029 1718 aa25.79■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFTRP13569 1480 aa25.77■■□□□ 1.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.61■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.59■■□□□ 1.69
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.56■■□□□ 1.68
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF27Q86VH2 1401 aa25.45■■□□□ 1.66
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.43■■□□□ 1.66
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.24■■□□□ 1.63
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARAP1Q96P48 1450 aa25.21■■□□□ 1.63
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APLP2Q06481 763 aa25.14■■□□□ 1.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.12■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NESP48681 1621 aa25.08■■□□□ 1.61
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TOPBP1Q92547 1522 aa25.07■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.06■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.03■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.03■■□□□ 1.6
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.95■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR97A6NE52 1622 aa24.95■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CUL7Q14999 1698 aa24.93■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.86■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAP3K1Q13233 1512 aa24.85■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.82■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.81■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.8■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TIAM1Q13009 1591 aa24.78■■□□□ 1.56
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.75■■□□□ 1.55
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.74■■□□□ 1.55
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