RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522721.1

SORBS3-215, Transcript of sorbin and SH3 domain containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene SORBS3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3-215ENST00000522721 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.49■■■■■ 6.79
SORBS3-215ENST00000522721 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.25■■■■■ 5.79
SORBS3-215ENST00000522721 ABCC9O60706 1549 aa50.57■■■■■ 5.69
SORBS3-215ENST00000522721 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.45■■■■■ 5.35
SORBS3-215ENST00000522721 NACADO15069 1562 aa48.31■■■■■ 5.32
SORBS3-215ENST00000522721 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.05■■■■■ 5.28
SORBS3-215ENST00000522721 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.94■■■■■ 5.26
SORBS3-215ENST00000522721 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
SORBS3-215ENST00000522721 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.57■■■■■ 5.21
SORBS3-215ENST00000522721 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.33■■■■■ 5.17
SORBS3-215ENST00000522721 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.19■■■■■ 5.142e-8■■□□□ 14
SORBS3-215ENST00000522721 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.08■■■■■ 5.13
SORBS3-215ENST00000522721 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.9■■■■■ 5.1
SORBS3-215ENST00000522721 SCRIBQ14160 1630 aa46.72■■■■■ 5.07
SORBS3-215ENST00000522721 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.53■■■■■ 5.04
SORBS3-215ENST00000522721 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.84■■■■■ 4.93
SORBS3-215ENST00000522721 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.74■■■■■ 4.91
SORBS3-215ENST00000522721 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.51■■■■■ 4.88
SORBS3-215ENST00000522721 SMARCA4P51532 1647 aa44.68■■■■■ 4.74
SORBS3-215ENST00000522721 NCAPD3P42695 1498 aa44.63■■■■■ 4.73
SORBS3-215ENST00000522721 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.58■■■■■ 4.73
SORBS3-215ENST00000522721 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
SORBS3-215ENST00000522721 SMARCA2P51531 1590 aa44.45■■■■■ 4.71
SORBS3-215ENST00000522721 HMGXB3Q12766 1538 aa44.35■■■■■ 4.69
SORBS3-215ENST00000522721 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.31■■■■■ 4.68
SORBS3-215ENST00000522721 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.3■■■■■ 4.68
SORBS3-215ENST00000522721 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
SORBS3-215ENST00000522721 WIZO95785 1651 aa43.75■■■■■ 4.59
SORBS3-215ENST00000522721 NESP48681 1621 aa43.67■■■■■ 4.58
SORBS3-215ENST00000522721 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
SORBS3-215ENST00000522721 ERCC6Q03468 1493 aa43.58■■■■■ 4.57
SORBS3-215ENST00000522721 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.47■■■■■ 4.55
SORBS3-215ENST00000522721 CUX2O14529 1486 aa43.35■■■■■ 4.53
SORBS3-215ENST00000522721 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
SORBS3-215ENST00000522721 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.29■■■■■ 4.52
SORBS3-215ENST00000522721 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.18■■■■■ 4.5
SORBS3-215ENST00000522721 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
SORBS3-215ENST00000522721 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.08■■■■■ 4.49
SORBS3-215ENST00000522721 CFTRP13569 1480 aa42.95■■■■■ 4.47
SORBS3-215ENST00000522721 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.79■■■■■ 4.44
SORBS3-215ENST00000522721 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.79■■■■■ 4.44
SORBS3-215ENST00000522721 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.77■■■■■ 4.44
SORBS3-215ENST00000522721 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.74■■■■■ 4.43
SORBS3-215ENST00000522721 WDR62O43379 1518 aa42.69■■■■■ 4.42
SORBS3-215ENST00000522721 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.54■■■■■ 4.4
SORBS3-215ENST00000522721 PRDM2Q13029 1718 aa42.48■■■■■ 4.39
SORBS3-215ENST00000522721 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
SORBS3-215ENST00000522721 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
SORBS3-215ENST00000522721 TOPBP1Q92547 1522 aa42.05■■■■■ 4.32
SORBS3-215ENST00000522721 ABCC8Q09428 1581 aa41.97■■■■■ 4.31
SORBS3-215ENST00000522721 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.95■■■■■ 4.31
SORBS3-215ENST00000522721 IFT140Q96RY7 1462 aa41.88■■■■■ 4.29
SORBS3-215ENST00000522721 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
SORBS3-215ENST00000522721 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
SORBS3-215ENST00000522721 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
SORBS3-215ENST00000522721 CUX1P39880 1505 aa41.59■■■■■ 4.25
SORBS3-215ENST00000522721 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
SORBS3-215ENST00000522721 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.49■■■■■ 4.23
SORBS3-215ENST00000522721 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.49■■■■■ 4.23
SORBS3-215ENST00000522721 SOGA1O94964 1423 aa41.45■■■■■ 4.23
SORBS3-215ENST00000522721 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.222e-7■■■□□ 18
SORBS3-215ENST00000522721 OSCARQ8IYS5 282 aa41.42■■■■■ 4.22
SORBS3-215ENST00000522721 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
SORBS3-215ENST00000522721 WDR97A6NE52 1622 aa41.26■■■■■ 4.19
SORBS3-215ENST00000522721 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.17
SORBS3-215ENST00000522721 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.09■■■■■ 4.17
SORBS3-215ENST00000522721 TOP2BQ02880 1626 aa41.08■■■■■ 4.17
SORBS3-215ENST00000522721 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.07■■■■■ 4.17
SORBS3-215ENST00000522721 SYNJ1O43426 1573 aa41.06■■■■■ 4.16
SORBS3-215ENST00000522721 CHD1O14646 1710 aa41.05■■■■■ 4.16
SORBS3-215ENST00000522721 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.05■■■■■ 4.16
SORBS3-215ENST00000522721 GRIN2BQ13224 1484 aa41.03■■■■■ 4.16
SORBS3-215ENST00000522721 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
SORBS3-215ENST00000522721 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.97■■■■■ 4.15
SORBS3-215ENST00000522721 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.96■■■■■ 4.15
SORBS3-215ENST00000522721 FBLN2P98095 1184 aa40.93■■■■■ 4.14
SORBS3-215ENST00000522721 PBRM1Q86U86 1689 aa40.87■■■■■ 4.13
SORBS3-215ENST00000522721 TRIM41Q8WV44 630 aa40.86■■■■■ 4.13
SORBS3-215ENST00000522721 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.83■■■■■ 4.13
SORBS3-215ENST00000522721 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.83■■■■■ 4.13
SORBS3-215ENST00000522721 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.83■■■■■ 4.13
SORBS3-215ENST00000522721 SYNJ2O15056 1496 aa40.83■■■■■ 4.13
SORBS3-215ENST00000522721 ARHGEF11O15085 1522 aa40.81■■■■■ 4.12
SORBS3-215ENST00000522721 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
SORBS3-215ENST00000522721 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.69■■■■■ 4.1
SORBS3-215ENST00000522721 ADAMTS12P58397 1594 aa40.59■■■■■ 4.09
SORBS3-215ENST00000522721 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.57■■■■■ 4.08
SORBS3-215ENST00000522721 GRIN2AQ12879 1464 aa40.51■■■■■ 4.08
SORBS3-215ENST00000522721 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.5■■■■■ 4.07
SORBS3-215ENST00000522721 ARAP1Q96P48 1450 aa40.48■■■■■ 4.07
SORBS3-215ENST00000522721 NUP160Q12769 1436 aa40.4■■■■■ 4.06
SORBS3-215ENST00000522721 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.39■■■■■ 4.06
SORBS3-215ENST00000522721 CEP170Q5SW79 1584 aa40.35■■■■■ 4.05
SORBS3-215ENST00000522721 KIF27Q86VH2 1401 aa40.27■■■■■ 4.04
SORBS3-215ENST00000522721 IGF1RP08069 1367 aa40.23■■■■■ 4.03
SORBS3-215ENST00000522721 SHROOM2Q13796 1616 aa40.12■■■■■ 4.01
SORBS3-215ENST00000522721 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.09■■■■■ 4.01
SORBS3-215ENST00000522721 CUL7Q14999 1698 aa40.07■■■■■ 4
SORBS3-215ENST00000522721 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.01■■■■□ 3.99
SORBS3-215ENST00000522721 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.94■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 170.6 ms