RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589057.5

APOC4-APOC2-202, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene APOC4-APOC2, Length 680 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.88■■■□□ 2.05
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.78■■□□□ 1.4
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.41■■□□□ 1.34
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.78■■□□□ 1.24
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.58■■□□□ 1.21
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.7■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 SHROOM2Q13796 1616 aa19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.52■□□□□ 0.72
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APOC4-APOC2-202ENST00000589057 JPH4Q96JJ6 628 aa19.49■□□□□ 0.71
APOC4-APOC2-202ENST00000589057 IGF1RP08069 1367 aa19.46■□□□□ 0.71
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