Protein–RNA interactions for Protein: Q12999

TSPAN31, Tetraspanin-31, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN31Q12999 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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TSPAN31Q12999 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN31Q12999 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN31Q12999 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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TSPAN31Q12999 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN31Q12999 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
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TSPAN31Q12999 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN31Q12999 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN31Q12999 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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