Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPIBQ01892 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIBQ01892 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIBQ01892 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIBQ01892 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms