Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SPIBQ01892 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SPIBQ01892 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SPIBQ01892 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SPIBQ01892 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPIBQ01892 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPIBQ01892 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SPIBQ01892 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPIBQ01892 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SPIBQ01892 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SPIBQ01892 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SPIBQ01892 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SPIBQ01892 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPIBQ01892 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPIBQ01892 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPIBQ01892 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPIBQ01892 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPIBQ01892 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPIBQ01892 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPIBQ01892 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPIBQ01892 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPIBQ01892 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPIBQ01892 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPIBQ01892 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPIBQ01892 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPIBQ01892 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPIBQ01892 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SPIBQ01892 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPIBQ01892 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPIBQ01892 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPIBQ01892 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPIBQ01892 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPIBQ01892 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPIBQ01892 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPIBQ01892 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SPIBQ01892 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPIBQ01892 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPIBQ01892 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPIBQ01892 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPIBQ01892 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIBQ01892 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIBQ01892 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIBQ01892 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPIBQ01892 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPIBQ01892 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SPIBQ01892 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPIBQ01892 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPIBQ01892 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPIBQ01892 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPIBQ01892 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPIBQ01892 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPIBQ01892 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPIBQ01892 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPIBQ01892 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPIBQ01892 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPIBQ01892 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPIBQ01892 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPIBQ01892 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPIBQ01892 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPIBQ01892 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIBQ01892 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPIBQ01892 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIBQ01892 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPIBQ01892 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SPIBQ01892 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPIBQ01892 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SPIBQ01892 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SPIBQ01892 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPIBQ01892 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPIBQ01892 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPIBQ01892 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPIBQ01892 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPIBQ01892 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SPIBQ01892 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPIBQ01892 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPIBQ01892 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPIBQ01892 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIBQ01892 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPIBQ01892 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPIBQ01892 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPIBQ01892 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPIBQ01892 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPIBQ01892 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIBQ01892 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIBQ01892 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPIBQ01892 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIBQ01892 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIBQ01892 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIBQ01892 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIBQ01892 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIBQ01892 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIBQ01892 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPIBQ01892 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPIBQ01892 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPIBQ01892 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPIBQ01892 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPIBQ01892 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPIBQ01892 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPIBQ01892 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPIBQ01892 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms