Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZBED6P86452 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZBED6P86452 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZBED6P86452 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZBED6P86452 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZBED6P86452 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED6P86452 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED6P86452 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED6P86452 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED6P86452 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED6P86452 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZBED6P86452 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED6P86452 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED6P86452 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED6P86452 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED6P86452 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZBED6P86452 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED6P86452 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED6P86452 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ZBED6P86452 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED6P86452 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED6P86452 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ZBED6P86452 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED6P86452 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED6P86452 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED6P86452 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZBED6P86452 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZBED6P86452 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 407.5 ms