Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2JP52435 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2JP52435 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
POLR2JP52435 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
POLR2JP52435 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
POLR2JP52435 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
POLR2JP52435 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms