Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA3P15088 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA3P15088 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA3P15088 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA3P15088 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPA3P15088 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA3P15088 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA3P15088 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA3P15088 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA3P15088 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPA3P15088 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA3P15088 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA3P15088 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA3P15088 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPA3P15088 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA3P15088 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA3P15088 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA3P15088 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA3P15088 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPA3P15088 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA3P15088 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPA3P15088 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA3P15088 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPA3P15088 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPA3P15088 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA3P15088 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CPA3P15088 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA3P15088 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA3P15088 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA3P15088 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA3P15088 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA3P15088 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA3P15088 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA3P15088 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA3P15088 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA3P15088 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA3P15088 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA3P15088 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA3P15088 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA3P15088 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA3P15088 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA3P15088 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA3P15088 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA3P15088 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA3P15088 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPA3P15088 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA3P15088 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA3P15088 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA3P15088 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA3P15088 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA3P15088 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA3P15088 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA3P15088 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA3P15088 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA3P15088 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA3P15088 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA3P15088 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA3P15088 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA3P15088 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA3P15088 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA3P15088 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA3P15088 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA3P15088 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA3P15088 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA3P15088 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA3P15088 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA3P15088 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA3P15088 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA3P15088 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPA3P15088 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA3P15088 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPA3P15088 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPA3P15088 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPA3P15088 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CPA3P15088 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA3P15088 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA3P15088 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA3P15088 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA3P15088 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA3P15088 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPA3P15088 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA3P15088 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA3P15088 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA3P15088 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CPA3P15088 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA3P15088 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA3P15088 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CPA3P15088 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA3P15088 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CPA3P15088 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA3P15088 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA3P15088 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA3P15088 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA3P15088 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CPA3P15088 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA3P15088 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA3P15088 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA3P15088 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CPA3P15088 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPA3P15088 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms