Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BHLHE40O14503 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHLHE40O14503 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHLHE40O14503 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BHLHE40O14503 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BHLHE40O14503 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms