Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMIM19Q96E16 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMIM19Q96E16 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM19Q96E16 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM19Q96E16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM19Q96E16 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms