Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR2

RETREG3, Reticulophagy regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG3Q86VR2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RETREG3Q86VR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RETREG3Q86VR2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RETREG3Q86VR2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RETREG3Q86VR2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RETREG3Q86VR2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms