Protein–RNA interactions for Protein: Q86UE6

LRRTM1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1Q86UE6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRTM1Q86UE6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRTM1Q86UE6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM1Q86UE6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRTM1Q86UE6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRTM1Q86UE6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms