Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 215.96■□□□□ 0.151e-8■□□□□ 10.5
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NIPBLQ6KC79 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 515.69■□□□□ 0.11e-8■□□□□ 10.5
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NIPBLQ6KC79 DNAJB1-209ENST00000598692 567 ntTSL 211.85□□□□□ -0.517e-6■□□□□ 10.5
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NIPBLQ6KC79 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.67e-6■□□□□ 10.5
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NIPBLQ6KC79 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.617e-6■□□□□ 10.5
NIPBLQ6KC79 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.617e-6■□□□□ 10.5
NIPBLQ6KC79 BLMH-204ENST00000577623 823 ntTSL 511.18□□□□□ -0.627e-6■□□□□ 10.5
NIPBLQ6KC79 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.647e-6■□□□□ 10.5
NIPBLQ6KC79 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.677e-6■□□□□ 10.5
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