RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531065.5

RPS2-211, Transcript of ribosomal protein S2, humanhuman

TSL 5

Gene RPS2, Length 1,548 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS2-211ENST00000531065 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.65■■■■■ 8.26
RPS2-211ENST00000531065 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.28■■■■■ 7.08
RPS2-211ENST00000531065 ABCC9O60706 1549 aa58.1■■■■■ 6.89
RPS2-211ENST00000531065 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.78■■■■■ 6.52
RPS2-211ENST00000531065 NACADO15069 1562 aa55.7■■■■■ 6.51
RPS2-211ENST00000531065 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.67■■■■■ 6.5
RPS2-211ENST00000531065 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.53■■■■■ 6.48
RPS2-211ENST00000531065 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.3■■■■■ 6.44
RPS2-211ENST00000531065 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.08■■■■■ 6.41
RPS2-211ENST00000531065 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.74■■■■■ 6.35
RPS2-211ENST00000531065 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.28■■■■■ 6.28
RPS2-211ENST00000531065 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.23■■■■■ 6.27
RPS2-211ENST00000531065 SCRIBQ14160 1630 aa54.18■■■■■ 6.26
RPS2-211ENST00000531065 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.43■■■■■ 6.14
RPS2-211ENST00000531065 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.41■■■■■ 6.14
RPS2-211ENST00000531065 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.74■■■■■ 6.03
RPS2-211ENST00000531065 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.56■■■■■ 6.01
RPS2-211ENST00000531065 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.15■■■■■ 5.94
RPS2-211ENST00000531065 SMARCA4P51532 1647 aa51.77■■■■■ 5.88
RPS2-211ENST00000531065 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.63■■■■■ 5.86
RPS2-211ENST00000531065 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.46■■■■■ 5.83
RPS2-211ENST00000531065 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.44■■■■■ 5.82
RPS2-211ENST00000531065 NCAPD3P42695 1498 aa51.38■■■■■ 5.82
RPS2-211ENST00000531065 SMARCA2P51531 1590 aa51.34■■■■■ 5.81
RPS2-211ENST00000531065 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.21■■■■■ 5.79
RPS2-211ENST00000531065 HMGXB3Q12766 1538 aa51.15■■■■■ 5.78
RPS2-211ENST00000531065 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.02■■■■■ 5.76
RPS2-211ENST00000531065 WIZO95785 1651 aa50.93■■■■■ 5.74
RPS2-211ENST00000531065 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.77■■■■■ 5.72
RPS2-211ENST00000531065 NESP48681 1621 aa50.31■■■■■ 5.65
RPS2-211ENST00000531065 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.28■■■■■ 5.64
RPS2-211ENST00000531065 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.06■■■■■ 5.6
RPS2-211ENST00000531065 ERCC6Q03468 1493 aa50■■■■■ 5.59
RPS2-211ENST00000531065 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.88■■■■■ 5.58
RPS2-211ENST00000531065 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.75■■■■■ 5.55
RPS2-211ENST00000531065 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.7■■■■■ 5.55
RPS2-211ENST00000531065 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.66■■■■■ 5.54
RPS2-211ENST00000531065 CFTRP13569 1480 aa49.61■■■■■ 5.53
RPS2-211ENST00000531065 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.55■■■■■ 5.52
RPS2-211ENST00000531065 CUX2O14529 1486 aa49.45■■■■■ 5.51
RPS2-211ENST00000531065 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.51
RPS2-211ENST00000531065 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.36■■■■■ 5.49
RPS2-211ENST00000531065 PRDM2Q13029 1718 aa49.34■■■■■ 5.49
RPS2-211ENST00000531065 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.29■■■■■ 5.48
RPS2-211ENST00000531065 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.23■■■■■ 5.47
RPS2-211ENST00000531065 WDR62O43379 1518 aa49.1■■■■■ 5.45
RPS2-211ENST00000531065 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.93■■■■■ 5.42
RPS2-211ENST00000531065 TOPBP1Q92547 1522 aa48.59■■■■■ 5.37
RPS2-211ENST00000531065 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.51■■■■■ 5.36
RPS2-211ENST00000531065 ABCC8Q09428 1581 aa48.44■■■■■ 5.34
RPS2-211ENST00000531065 CUX1P39880 1505 aa48.26■■■■■ 5.32
RPS2-211ENST00000531065 IFT140Q96RY7 1462 aa48.22■■■■■ 5.31
RPS2-211ENST00000531065 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.18■■■■■ 5.3
RPS2-211ENST00000531065 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.13■■■■■ 5.3
RPS2-211ENST00000531065 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
RPS2-211ENST00000531065 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.06■■■■■ 5.28
RPS2-211ENST00000531065 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.01■■■■■ 5.28
RPS2-211ENST00000531065 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48■■■■■ 5.27
RPS2-211ENST00000531065 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.95■■■■■ 5.27
RPS2-211ENST00000531065 SOGA1O94964 1423 aa47.92■■■■■ 5.26
RPS2-211ENST00000531065 SYNJ1O43426 1573 aa47.84■■■■■ 5.25
RPS2-211ENST00000531065 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.83■■■■■ 5.25not detected■■■■□ 25.1
RPS2-211ENST00000531065 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.81■■■■■ 5.24not detected■■■■■ 31.4
RPS2-211ENST00000531065 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.81■■■■■ 5.24
RPS2-211ENST00000531065 TOP2BQ02880 1626 aa47.78■■■■■ 5.24
RPS2-211ENST00000531065 WDR97A6NE52 1622 aa47.74■■■■■ 5.23
RPS2-211ENST00000531065 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.7■■■■■ 5.23
RPS2-211ENST00000531065 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.55■■■■■ 5.2
RPS2-211ENST00000531065 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.43■■■■■ 5.18
RPS2-211ENST00000531065 PBRM1Q86U86 1689 aa47.41■■■■■ 5.18
RPS2-211ENST00000531065 CHD1O14646 1710 aa47.4■■■■■ 5.18
RPS2-211ENST00000531065 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.39■■■■■ 5.18
RPS2-211ENST00000531065 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.37■■■■■ 5.17
RPS2-211ENST00000531065 OSCARQ8IYS5 282 aa47.36■■■■■ 5.17
RPS2-211ENST00000531065 GRIN2BQ13224 1484 aa47.36■■■■■ 5.17
RPS2-211ENST00000531065 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.24■■■■■ 5.15
RPS2-211ENST00000531065 FBLN2P98095 1184 aa47.18■■■■■ 5.14
RPS2-211ENST00000531065 SYNJ2O15056 1496 aa47.07■■■■■ 5.13
RPS2-211ENST00000531065 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47■■■■■ 5.12
RPS2-211ENST00000531065 ADAMTS12P58397 1594 aa46.98■■■■■ 5.11
RPS2-211ENST00000531065 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.97■■■■■ 5.11
RPS2-211ENST00000531065 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.81■■■■■ 5.08
RPS2-211ENST00000531065 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.81■■■■■ 5.08
RPS2-211ENST00000531065 KIF27Q86VH2 1401 aa46.79■■■■■ 5.08
RPS2-211ENST00000531065 GRIN2AQ12879 1464 aa46.79■■■■■ 5.08
RPS2-211ENST00000531065 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.79■■■■■ 5.08
RPS2-211ENST00000531065 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.79■■■■■ 5.08
RPS2-211ENST00000531065 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.79■■■■■ 5.08
RPS2-211ENST00000531065 ARHGEF11O15085 1522 aa46.72■■■■■ 5.07
RPS2-211ENST00000531065 IGF1RP08069 1367 aa46.66■■■■■ 5.06
RPS2-211ENST00000531065 CEP170Q5SW79 1584 aa46.63■■■■■ 5.06
RPS2-211ENST00000531065 TRIM41Q8WV44 630 aa46.62■■■■■ 5.05
RPS2-211ENST00000531065 NUP160Q12769 1436 aa46.58■■■■■ 5.05
RPS2-211ENST00000531065 CUL7Q14999 1698 aa46.56■■■■■ 5.04
RPS2-211ENST00000531065 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.54■■■■■ 5.04
RPS2-211ENST00000531065 ARAP1Q96P48 1450 aa46.37■■■■■ 5.01
RPS2-211ENST00000531065 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.36■■■■■ 5.01
RPS2-211ENST00000531065 SHROOM2Q13796 1616 aa46.28■■■■■ 5
RPS2-211ENST00000531065 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.25■■■■■ 4.99
RPS2-211ENST00000531065 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.23■■■■■ 4.99
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