RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328834.9

CNOT10-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT10, Length 2,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-201ENST00000328834 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.82■■■□□ 2.37
CNOT10-201ENST00000328834 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.42■■□□□ 1.82
CNOT10-201ENST00000328834 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CNOT10-201ENST00000328834 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.55■■□□□ 1.68
CNOT10-201ENST00000328834 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CNOT10-201ENST00000328834 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.11■■□□□ 1.61
CNOT10-201ENST00000328834 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.02■■□□□ 1.6
CNOT10-201ENST00000328834 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.88■■□□□ 1.57
CNOT10-201ENST00000328834 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.76■■□□□ 1.55
CNOT10-201ENST00000328834 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.65■■□□□ 1.54
CNOT10-201ENST00000328834 HRCP23327 699 aa24.6■■□□□ 1.53
CNOT10-201ENST00000328834 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CNOT10-201ENST00000328834 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.26■■□□□ 1.47
CNOT10-201ENST00000328834 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CNOT10-201ENST00000328834 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.06■■□□□ 1.44
CNOT10-201ENST00000328834 SCRIBQ14160 1630 aa24■■□□□ 1.43
CNOT10-201ENST00000328834 TRIM41Q8WV44 630 aa23.88■■□□□ 1.41
CNOT10-201ENST00000328834 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CNOT10-201ENST00000328834 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CNOT10-201ENST00000328834 ABCC9O60706 1549 aa23.83■■□□□ 1.41
CNOT10-201ENST00000328834 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.73■■□□□ 1.39
CNOT10-201ENST00000328834 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.6■■□□□ 1.37
CNOT10-201ENST00000328834 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CNOT10-201ENST00000328834 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.41■■□□□ 1.34
CNOT10-201ENST00000328834 WIZO95785 1651 aa23.33■■□□□ 1.32
CNOT10-201ENST00000328834 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CNOT10-201ENST00000328834 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CNOT10-201ENST00000328834 NACADO15069 1562 aa23.07■■□□□ 1.28
CNOT10-201ENST00000328834 ABCC8Q09428 1581 aa23.04■■□□□ 1.28
CNOT10-201ENST00000328834 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CNOT10-201ENST00000328834 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CNOT10-201ENST00000328834 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.94■■□□□ 1.26
CNOT10-201ENST00000328834 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
CNOT10-201ENST00000328834 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CNOT10-201ENST00000328834 SOGA1O94964 1423 aa22.87■■□□□ 1.25
CNOT10-201ENST00000328834 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.82■■□□□ 1.24
CNOT10-201ENST00000328834 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CNOT10-201ENST00000328834 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CNOT10-201ENST00000328834 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CNOT10-201ENST00000328834 CEP162Q5TB80 1403 aa22.72■■□□□ 1.23
CNOT10-201ENST00000328834 NEUROD1Q13562 356 aa22.7■■□□□ 1.22
CNOT10-201ENST00000328834 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CNOT10-201ENST00000328834 SMARCA2P51531 1590 aa22.67■■□□□ 1.22
CNOT10-201ENST00000328834 SMARCA4P51532 1647 aa22.66■■□□□ 1.22
CNOT10-201ENST00000328834 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CNOT10-201ENST00000328834 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.63■■□□□ 1.21
CNOT10-201ENST00000328834 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CNOT10-201ENST00000328834 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.57■■□□□ 1.2
CNOT10-201ENST00000328834 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CNOT10-201ENST00000328834 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CNOT10-201ENST00000328834 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.49■■□□□ 1.19
CNOT10-201ENST00000328834 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.48■■□□□ 1.19
CNOT10-201ENST00000328834 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
CNOT10-201ENST00000328834 GOLGA3Q08378 1498 aa22.33■■□□□ 1.17
CNOT10-201ENST00000328834 SYNJ1O43426 1573 aa22.31■■□□□ 1.16
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CNOT10-201ENST00000328834 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.29■■□□□ 1.16
CNOT10-201ENST00000328834 MIER1Q8N108 512 aa22.25■■□□□ 1.15
CNOT10-201ENST00000328834 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CNOT10-201ENST00000328834 CLIP1P30622 1438 aa22.24■■□□□ 1.15
CNOT10-201ENST00000328834 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT10-201ENST00000328834 EEA1Q15075 1411 aa22.21■■□□□ 1.15
CNOT10-201ENST00000328834 APLP2Q06481 763 aa22.18■■□□□ 1.14
CNOT10-201ENST00000328834 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CNOT10-201ENST00000328834 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.14■■□□□ 1.13
CNOT10-201ENST00000328834 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.1■■□□□ 1.13
CNOT10-201ENST00000328834 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CNOT10-201ENST00000328834 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT10-201ENST00000328834 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CNOT10-201ENST00000328834 ITGAEP38570 1179 aa22.04■■□□□ 1.12
CNOT10-201ENST00000328834 KIF21BO75037 1637 aa21.99■■□□□ 1.11
CNOT10-201ENST00000328834 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.94■■□□□ 1.1
CNOT10-201ENST00000328834 ARAP1Q96P48 1450 aa21.82■■□□□ 1.08
CNOT10-201ENST00000328834 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CNOT10-201ENST00000328834 TOP2BQ02880 1626 aa21.79■■□□□ 1.08
CNOT10-201ENST00000328834 P3H3Q8IVL6 736 aa21.73■■□□□ 1.07
CNOT10-201ENST00000328834 CUX1P39880 1505 aa21.72■■□□□ 1.07
CNOT10-201ENST00000328834 PRXQ9BXM0 1461 aa21.71■■□□□ 1.07
CNOT10-201ENST00000328834 KCNH8Q96L42 1107 aa21.7■■□□□ 1.07
CNOT10-201ENST00000328834 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.07
CNOT10-201ENST00000328834 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.62■■□□□ 1.05
CNOT10-201ENST00000328834 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CNOT10-201ENST00000328834 KIF27Q86VH2 1401 aa21.6■■□□□ 1.05
CNOT10-201ENST00000328834 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.59■■□□□ 1.05
CNOT10-201ENST00000328834 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CNOT10-201ENST00000328834 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.56■■□□□ 1.04
CNOT10-201ENST00000328834 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.56■■□□□ 1.04
CNOT10-201ENST00000328834 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.55■■□□□ 1.04
CNOT10-201ENST00000328834 CUX2O14529 1486 aa21.52■■□□□ 1.04
CNOT10-201ENST00000328834 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.51■■□□□ 1.03
CNOT10-201ENST00000328834 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CNOT10-201ENST00000328834 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CNOT10-201ENST00000328834 BCANQ96GW7 911 aa21.47■■□□□ 1.03
CNOT10-201ENST00000328834 NCAPD3P42695 1498 aa21.47■■□□□ 1.03
CNOT10-201ENST00000328834 IGF1RP08069 1367 aa21.46■■□□□ 1.03
CNOT10-201ENST00000328834 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CNOT10-201ENST00000328834 CFTRP13569 1480 aa21.44■■□□□ 1.02
CNOT10-201ENST00000328834 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.42■■□□□ 1.02
CNOT10-201ENST00000328834 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.41■■□□□ 1.02
CNOT10-201ENST00000328834 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.39■■□□□ 1.01
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