RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530074.1

HGH1-203, Transcript of HGH1 homolog, humanhuman

TSL 3

Gene HGH1, Length 702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGH1-203ENST00000530074 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.5■■■■■ 6.8
HGH1-203ENST00000530074 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.5■■■■■ 5.84
HGH1-203ENST00000530074 ABCC9O60706 1549 aa50.96■■■■■ 5.75
HGH1-203ENST00000530074 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.75■■■■■ 5.39
HGH1-203ENST00000530074 NACADO15069 1562 aa48.53■■■■■ 5.36
HGH1-203ENST00000530074 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.16■■■■■ 5.3
HGH1-203ENST00000530074 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.04■■■■■ 5.28
HGH1-203ENST00000530074 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.78■■■■■ 5.24
HGH1-203ENST00000530074 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.76■■■■■ 5.24
HGH1-203ENST00000530074 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.58■■■■■ 5.21
HGH1-203ENST00000530074 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.44■■■■■ 5.18
HGH1-203ENST00000530074 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.41■■■■■ 5.18
HGH1-203ENST00000530074 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.36■■■■■ 5.17
HGH1-203ENST00000530074 SCRIBQ14160 1630 aa46.87■■■■■ 5.09
HGH1-203ENST00000530074 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.76■■■■■ 5.08
HGH1-203ENST00000530074 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.13■■■■■ 4.98
HGH1-203ENST00000530074 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.12■■■■■ 4.97
HGH1-203ENST00000530074 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.87■■■■■ 4.93
HGH1-203ENST00000530074 SMARCA4P51532 1647 aa44.8■■■■■ 4.76
HGH1-203ENST00000530074 NCAPD3P42695 1498 aa44.78■■■■■ 4.76
HGH1-203ENST00000530074 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.69■■■■■ 4.74
HGH1-203ENST00000530074 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
HGH1-203ENST00000530074 SMARCA2P51531 1590 aa44.6■■■■■ 4.73
HGH1-203ENST00000530074 HMGXB3Q12766 1538 aa44.53■■■■■ 4.72
HGH1-203ENST00000530074 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.4■■■■■ 4.7
HGH1-203ENST00000530074 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.31■■■■■ 4.68
HGH1-203ENST00000530074 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.27■■■■■ 4.68
HGH1-203ENST00000530074 ERCC6Q03468 1493 aa43.94■■■■■ 4.62
HGH1-203ENST00000530074 NESP48681 1621 aa43.91■■■■■ 4.62
HGH1-203ENST00000530074 WIZO95785 1651 aa43.82■■■■■ 4.61
HGH1-203ENST00000530074 CUX2O14529 1486 aa43.78■■■■■ 4.6
HGH1-203ENST00000530074 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.74■■■■■ 4.59
HGH1-203ENST00000530074 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.52■■■■■ 4.56
HGH1-203ENST00000530074 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
HGH1-203ENST00000530074 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.45■■■■■ 4.55
HGH1-203ENST00000530074 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.4■■■■■ 4.54
HGH1-203ENST00000530074 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.39■■■■■ 4.54
HGH1-203ENST00000530074 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
HGH1-203ENST00000530074 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.21■■■■■ 4.51
HGH1-203ENST00000530074 CFTRP13569 1480 aa43.03■■■■■ 4.48
HGH1-203ENST00000530074 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.01■■■■■ 4.48
HGH1-203ENST00000530074 WDR62O43379 1518 aa42.95■■■■■ 4.47
HGH1-203ENST00000530074 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.93■■■■■ 4.46
HGH1-203ENST00000530074 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.92■■■■■ 4.46
HGH1-203ENST00000530074 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.76■■■■■ 4.44
HGH1-203ENST00000530074 PRDM2Q13029 1718 aa42.76■■■■■ 4.44
HGH1-203ENST00000530074 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
HGH1-203ENST00000530074 TOPBP1Q92547 1522 aa42.18■■■■■ 4.34
HGH1-203ENST00000530074 ABCC8Q09428 1581 aa42.1■■■■■ 4.33
HGH1-203ENST00000530074 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.08■■■■■ 4.33
HGH1-203ENST00000530074 IFT140Q96RY7 1462 aa42.05■■■■■ 4.32
HGH1-203ENST00000530074 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
HGH1-203ENST00000530074 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
HGH1-203ENST00000530074 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
HGH1-203ENST00000530074 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
HGH1-203ENST00000530074 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
HGH1-203ENST00000530074 OSCARQ8IYS5 282 aa41.76■■■■■ 4.28
HGH1-203ENST00000530074 CUX1P39880 1505 aa41.61■■■■■ 4.25
HGH1-203ENST00000530074 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
HGH1-203ENST00000530074 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.58■■■■■ 4.25
HGH1-203ENST00000530074 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.56■■■■■ 4.24
HGH1-203ENST00000530074 SOGA1O94964 1423 aa41.53■■■■■ 4.24
HGH1-203ENST00000530074 WDR97A6NE52 1622 aa41.44■■■■■ 4.22
HGH1-203ENST00000530074 CHD1O14646 1710 aa41.42■■■■■ 4.22
HGH1-203ENST00000530074 TRIM41Q8WV44 630 aa41.42■■■■■ 4.22
HGH1-203ENST00000530074 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
HGH1-203ENST00000530074 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.29■■■■■ 4.2
HGH1-203ENST00000530074 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.29■■■■■ 4.2
HGH1-203ENST00000530074 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.29■■■■■ 4.2
HGH1-203ENST00000530074 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.21■■■■■ 4.19
HGH1-203ENST00000530074 ARHGEF11O15085 1522 aa41.18■■■■■ 4.18
HGH1-203ENST00000530074 GRIN2BQ13224 1484 aa41.15■■■■■ 4.18
HGH1-203ENST00000530074 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.15■■■■■ 4.18
HGH1-203ENST00000530074 FBLN2P98095 1184 aa41.14■■■■■ 4.18
HGH1-203ENST00000530074 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.13■■■■■ 4.18
HGH1-203ENST00000530074 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.12■■■■■ 4.17
HGH1-203ENST00000530074 PBRM1Q86U86 1689 aa41.12■■■■■ 4.17
HGH1-203ENST00000530074 TOP2BQ02880 1626 aa41.08■■■■■ 4.17
HGH1-203ENST00000530074 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.08■■■■■ 4.17
HGH1-203ENST00000530074 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.07■■■■■ 4.16
HGH1-203ENST00000530074 SYNJ1O43426 1573 aa41.04■■■■■ 4.16
HGH1-203ENST00000530074 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.03■■■■■ 4.16
HGH1-203ENST00000530074 SYNJ2O15056 1496 aa40.98■■■■■ 4.15
HGH1-203ENST00000530074 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.94■■■■■ 4.14
HGH1-203ENST00000530074 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
HGH1-203ENST00000530074 ARAP1Q96P48 1450 aa40.81■■■■■ 4.12
HGH1-203ENST00000530074 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.74■■■■■ 4.11
HGH1-203ENST00000530074 ADAMTS12P58397 1594 aa40.72■■■■■ 4.11
HGH1-203ENST00000530074 GRIN2AQ12879 1464 aa40.65■■■■■ 4.1
HGH1-203ENST00000530074 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.64■■■■■ 4.1
HGH1-203ENST00000530074 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.56■■■■■ 4.08
HGH1-203ENST00000530074 CEP170Q5SW79 1584 aa40.51■■■■■ 4.08
HGH1-203ENST00000530074 NUP160Q12769 1436 aa40.5■■■■■ 4.07
HGH1-203ENST00000530074 SHROOM2Q13796 1616 aa40.34■■■■■ 4.05
HGH1-203ENST00000530074 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.31■■■■■ 4.04
HGH1-203ENST00000530074 KIF27Q86VH2 1401 aa40.22■■■■■ 4.03
HGH1-203ENST00000530074 CUL7Q14999 1698 aa40.15■■■■■ 4.02
HGH1-203ENST00000530074 IGF1RP08069 1367 aa40.15■■■■■ 4.02
HGH1-203ENST00000530074 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.15■■■■■ 4.02
HGH1-203ENST00000530074 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
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