RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS2-208ENST00000527871 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.97■■■■■ 7.35
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RPS2-208ENST00000527871 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.84■■■■■ 5.89
RPS2-208ENST00000527871 NACADO15069 1562 aa51.57■■■■■ 5.85
RPS2-208ENST00000527871 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.36■■■■■ 5.81
RPS2-208ENST00000527871 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.18■■■■■ 5.78
RPS2-208ENST00000527871 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.98■■■■■ 5.75
RPS2-208ENST00000527871 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.81■■■■■ 5.72
RPS2-208ENST00000527871 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.67■■■■■ 5.7
RPS2-208ENST00000527871 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.54■■■■■ 5.68
RPS2-208ENST00000527871 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.45■■■■■ 5.67
RPS2-208ENST00000527871 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.37■■■■■ 5.65
RPS2-208ENST00000527871 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.69■■■■■ 5.55
RPS2-208ENST00000527871 SCRIBQ14160 1630 aa49.68■■■■■ 5.54
RPS2-208ENST00000527871 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.19■■■■■ 5.46
RPS2-208ENST00000527871 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.14■■■■■ 5.46
RPS2-208ENST00000527871 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.06■■■■■ 5.44
RPS2-208ENST00000527871 NCAPD3P42695 1498 aa47.72■■■■■ 5.23
RPS2-208ENST00000527871 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.56■■■■■ 5.2
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RPS2-208ENST00000527871 SMARCA2P51531 1590 aa47.34■■■■■ 5.17
RPS2-208ENST00000527871 HMGXB3Q12766 1538 aa47.26■■■■■ 5.16
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RPS2-208ENST00000527871 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.99■■■■■ 5.11
RPS2-208ENST00000527871 ERCC6Q03468 1493 aa46.93■■■■■ 5.1
RPS2-208ENST00000527871 NESP48681 1621 aa46.87■■■■■ 5.09
RPS2-208ENST00000527871 CUX2O14529 1486 aa46.86■■■■■ 5.09
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RPS2-208ENST00000527871 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.49■■■■■ 5.03
RPS2-208ENST00000527871 WIZO95785 1651 aa46.37■■■■■ 5.01
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RPS2-208ENST00000527871 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
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RPS2-208ENST00000527871 WDR62O43379 1518 aa45.72■■■■■ 4.91
RPS2-208ENST00000527871 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.66■■■■■ 4.9
RPS2-208ENST00000527871 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.65■■■■■ 4.9
RPS2-208ENST00000527871 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.36■■■■■ 4.85
RPS2-208ENST00000527871 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
RPS2-208ENST00000527871 PRDM2Q13029 1718 aa45.09■■■■■ 4.81
RPS2-208ENST00000527871 TOPBP1Q92547 1522 aa44.83■■■■■ 4.77
RPS2-208ENST00000527871 OSCARQ8IYS5 282 aa44.82■■■■■ 4.77
RPS2-208ENST00000527871 IFT140Q96RY7 1462 aa44.78■■■■■ 4.76
RPS2-208ENST00000527871 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.74■■■■■ 4.75
RPS2-208ENST00000527871 ABCC8Q09428 1581 aa44.71■■■■■ 4.75
RPS2-208ENST00000527871 TRIM41Q8WV44 630 aa44.69■■■■■ 4.74
RPS2-208ENST00000527871 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.62■■■■■ 4.73
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RPS2-208ENST00000527871 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.39■■■■■ 4.7
RPS2-208ENST00000527871 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.69
RPS2-208ENST00000527871 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.36■■■■■ 4.69<1e-323■■■■■ 31.4
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RPS2-208ENST00000527871 SOGA1O94964 1423 aa44.2■■■■■ 4.67
RPS2-208ENST00000527871 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 CUX1P39880 1505 aa44.12■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.12■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.12■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.12■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.1■■■■■ 4.65
RPS2-208ENST00000527871 ARHGEF11O15085 1522 aa44.04■■■■■ 4.64
RPS2-208ENST00000527871 CHD1O14646 1710 aa43.99■■■■■ 4.63
RPS2-208ENST00000527871 FBLN2P98095 1184 aa43.97■■■■■ 4.63
RPS2-208ENST00000527871 WDR97A6NE52 1622 aa43.89■■■■■ 4.62
RPS2-208ENST00000527871 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.83■■■■■ 4.61
RPS2-208ENST00000527871 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.77■■■■■ 4.6
RPS2-208ENST00000527871 GRIN2BQ13224 1484 aa43.76■■■■■ 4.6
RPS2-208ENST00000527871 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
RPS2-208ENST00000527871 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
RPS2-208ENST00000527871 ARAP1Q96P48 1450 aa43.64■■■■■ 4.58
RPS2-208ENST00000527871 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.64■■■■■ 4.58
RPS2-208ENST00000527871 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.64■■■■■ 4.58
RPS2-208ENST00000527871 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.6■■■■■ 4.57
RPS2-208ENST00000527871 SYNJ2O15056 1496 aa43.6■■■■■ 4.57
RPS2-208ENST00000527871 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.51■■■■■ 4.56
RPS2-208ENST00000527871 SYNJ1O43426 1573 aa43.5■■■■■ 4.55
RPS2-208ENST00000527871 PBRM1Q86U86 1689 aa43.48■■■■■ 4.55
RPS2-208ENST00000527871 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.48■■■■■ 4.55<1e-323■■■■□ 25.1
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RPS2-208ENST00000527871 GRIN2AQ12879 1464 aa43.2■■■■■ 4.51
RPS2-208ENST00000527871 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
RPS2-208ENST00000527871 ADAMTS12P58397 1594 aa43.14■■■■■ 4.5
RPS2-208ENST00000527871 NUP160Q12769 1436 aa43.11■■■■■ 4.49
RPS2-208ENST00000527871 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.1■■■■■ 4.49
RPS2-208ENST00000527871 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.06■■■■■ 4.48
RPS2-208ENST00000527871 CEP170Q5SW79 1584 aa43.03■■■■■ 4.48
RPS2-208ENST00000527871 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.96■■■■■ 4.47
RPS2-208ENST00000527871 SHROOM2Q13796 1616 aa42.84■■■■■ 4.45
RPS2-208ENST00000527871 JPH4Q96JJ6 628 aa42.7■■■■■ 4.43
RPS2-208ENST00000527871 IGF1RP08069 1367 aa42.68■■■■■ 4.42
RPS2-208ENST00000527871 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
RPS2-208ENST00000527871 KIF27Q86VH2 1401 aa42.58■■■■■ 4.41
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