Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.623e-9■■■■■ 45.9
EXOSC5Q9NQT4 NUTM2A-AS1-207ENST00000433920 876 ntTSL 310.42□□□□□ -0.743e-9■■■■■ 45.9
EXOSC5Q9NQT4 NUTM2A-AS1-206ENST00000433530 401 ntTSL 34.13□□□□□ -1.753e-9■■■■■ 45.9
EXOSC5Q9NQT4 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.843e-9■■■■■ 45.9
EXOSC5Q9NQT4 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 45.8
EXOSC5Q9NQT4 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 45.7
EXOSC5Q9NQT4 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 45.7
EXOSC5Q9NQT4 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 45.7
EXOSC5Q9NQT4 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 45.7
EXOSC5Q9NQT4 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 45.7
EXOSC5Q9NQT4 TRAM1-204ENST00000521049 872 ntTSL 513.37□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 45.1
EXOSC5Q9NQT4 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 57.35□□□□□ -1.239e-7■■■■■ 45.1
EXOSC5Q9NQT4 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 53.88□□□□□ -1.799e-7■■■■■ 45.1
EXOSC5Q9NQT4 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 53.77□□□□□ -1.819e-7■■■■■ 45.1
EXOSC5Q9NQT4 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 53.32□□□□□ -1.889e-7■■■■■ 45.1
EXOSC5Q9NQT4 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.159e-7■■■■■ 45.1
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 412.33□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 45
EXOSC5Q9NQT4 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 27.13□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 45
EXOSC5Q9NQT4 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.714e-12■■■■■ 44.9
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD12-205ENST00000546007 978 ntTSL 53.43□□□□□ -1.863e-8■■■■■ 44.8
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD12-202ENST00000359158 2250 ntTSL 22.56□□□□□ -23e-8■■■■■ 44.8
EXOSC5Q9NQT4 C1GALT1-203ENST00000419721 591 ntTSL 316.75■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 44.7
EXOSC5Q9NQT4 C1GALT1-206ENST00000467716 458 ntTSL 514.09□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 44.7
EXOSC5Q9NQT4 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 44.7
EXOSC5Q9NQT4 C1GALT1-207ENST00000476068 1186 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 44.7
EXOSC5Q9NQT4 C1GALT1-204ENST00000429911 802 ntTSL 510□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 44.7
EXOSC5Q9NQT4 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 215.14■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 44.7
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD12-204ENST00000540578 1338 ntTSL 1 (best)11.21□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 44.7
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 44.7
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 44.7
EXOSC5Q9NQT4 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.658e-8■■■■■ 44.6
EXOSC5Q9NQT4 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.188e-8■■■■■ 44.6
EXOSC5Q9NQT4 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.218e-8■■■■■ 44.6
EXOSC5Q9NQT4 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.318e-8■■■■■ 44.6
EXOSC5Q9NQT4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 44.6
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD12-206ENST00000577992 390 ntTSL 318.03■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 44.5
EXOSC5Q9NQT4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 44.5
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD12-209ENST00000585234 313 ntTSL 312.09□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 44.5
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD12-207ENST00000581635 631 ntTSL 49.26□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 44.5
EXOSC5Q9NQT4 MKL2-204ENST00000572400 4351 ntTSL 27.57□□□□□ -1.26e-12■■■■■ 44.3
EXOSC5Q9NQT4 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.36e-12■■■■■ 44.3
EXOSC5Q9NQT4 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.356e-12■■■■■ 44.3
EXOSC5Q9NQT4 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.436e-12■■■■■ 44.3
EXOSC5Q9NQT4 MKL2-211ENST00000575537 618 ntTSL 55.5□□□□□ -1.536e-12■■■■■ 44.3
EXOSC5Q9NQT4 MKL2-210ENST00000574998 545 ntTSL 45.19□□□□□ -1.586e-12■■■■■ 44.3
EXOSC5Q9NQT4 MKL2-213ENST00000575833 486 ntTSL 33.93□□□□□ -1.786e-12■■■■■ 44.3
EXOSC5Q9NQT4 USP15-206ENST00000546718 559 ntTSL 211.69□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 USP15-217ENST00000551206 1022 ntTSL 210.28□□□□□ -0.766e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 USP15-215ENST00000549523 584 ntTSL 510□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 USP15-204ENST00000537297 579 ntTSL 28.61□□□□□ -1.036e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 USP15-202ENST00000312635 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 USP15-208ENST00000548524 648 ntTSL 27.46□□□□□ -1.226e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 USP15-212ENST00000549237 791 ntTSL 34.98□□□□□ -1.616e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 USP15-210ENST00000548836 579 ntTSL 34.56□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.423e-7■■■■■ 44.2
EXOSC5Q9NQT4 AC025465.1-201ENST00000503145 797 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.269e-7■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.068e-7■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.465e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.215e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-216ENST00000479525 1368 ntTSL 513.4□□□□□ -0.265e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.345e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.635e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 58.8□□□□□ -18e-7■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 43.9
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EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.455e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.515e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-215ENST00000475319 1543 ntTSL 25.55□□□□□ -1.525e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-208ENST00000436638 766 ntAPPRIS ALT2 TSL 35.51□□□□□ -1.535e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.535e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-206ENST00000417628 767 ntTSL 55.14□□□□□ -1.595e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-204ENST00000368292 854 ntTSL 54.96□□□□□ -1.625e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-211ENST00000460558 301 ntTSL 53.8□□□□□ -1.85e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 PCBD2-203ENST00000510013 361 ntTSL 53.6□□□□□ -1.838e-7■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 ECHDC1-205ENST00000368295 1966 ntTSL 53.53□□□□□ -1.845e-12■■■■■ 43.9
EXOSC5Q9NQT4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 43.8
EXOSC5Q9NQT4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 43.8
EXOSC5Q9NQT4 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 43.8
EXOSC5Q9NQT4 SPDYA-205ENST00000462832 2081 ntTSL 23.87□□□□□ -1.793e-7■■■■■ 43.8
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.283e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-201ENST00000260054 1688 ntTSL 213.11□□□□□ -0.313e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-215ENST00000529745 1053 ntTSL 312.22□□□□□ -0.453e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-216ENST00000529856 1039 ntTSL 310.14□□□□□ -0.793e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-210ENST00000528149 987 ntTSL 39.43□□□□□ -0.93e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-218ENST00000533761 1587 ntTSL 59.27□□□□□ -0.933e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-211ENST00000529073 719 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.973e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-214ENST00000529689 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.983e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-208ENST00000527025 777 ntTSL 57.11□□□□□ -1.273e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-219ENST00000534753 723 ntTSL 56.95□□□□□ -1.33e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-212ENST00000529312 773 ntTSL 56.12□□□□□ -1.433e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 CCDC90B-209ENST00000527495 612 ntTSL 53.61□□□□□ -1.833e-11■■■■■ 43.7
EXOSC5Q9NQT4 SRPK2-215ENST00000493638 715 ntTSL 32.83□□□□□ -1.961e-7■■■■■ 43.5
EXOSC5Q9NQT4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 43.5
EXOSC5Q9NQT4 TAF1B-205ENST00000434858 1592 ntTSL 26.23□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 43.5
EXOSC5Q9NQT4 SCML1-205ENST00000419185 817 ntTSL 312.81□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 43.4
EXOSC5Q9NQT4 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 43.4
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