RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577992.1

ANKRD12-206, Transcript of ankyrin repeat domain 12, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD12, Length 390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD12-206ENST00000577992 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.45■■■■■ 6.47
ANKRD12-206ENST00000577992 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.31■■■■■ 5.48
ANKRD12-206ENST00000577992 ABCC9O60706 1549 aa48.39■■■■■ 5.34
ANKRD12-206ENST00000577992 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.43■■■■■ 5.02
ANKRD12-206ENST00000577992 NACADO15069 1562 aa46.35■■■■■ 5.01
ANKRD12-206ENST00000577992 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.35■■■■■ 5.01
ANKRD12-206ENST00000577992 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
ANKRD12-206ENST00000577992 MYO15BQ96JP2 1530 aa46■■■■■ 4.95
ANKRD12-206ENST00000577992 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.81■■■■■ 4.92
ANKRD12-206ENST00000577992 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.52■■■■■ 4.88
ANKRD12-206ENST00000577992 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.21■■■■■ 4.83
ANKRD12-206ENST00000577992 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.13■■■■■ 4.82
ANKRD12-206ENST00000577992 SCRIBQ14160 1630 aa45.08■■■■■ 4.81
ANKRD12-206ENST00000577992 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.53■■■■■ 4.72
ANKRD12-206ENST00000577992 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.47■■■■■ 4.71
ANKRD12-206ENST00000577992 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
ANKRD12-206ENST00000577992 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.76■■■■■ 4.6
ANKRD12-206ENST00000577992 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.44■■■■■ 4.54
ANKRD12-206ENST00000577992 SMARCA4P51532 1647 aa43.07■■■■■ 4.48
ANKRD12-206ENST00000577992 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
ANKRD12-206ENST00000577992 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.83■■■■■ 4.45
ANKRD12-206ENST00000577992 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.79■■■■■ 4.44
ANKRD12-206ENST00000577992 NCAPD3P42695 1498 aa42.77■■■■■ 4.44
ANKRD12-206ENST00000577992 SMARCA2P51531 1590 aa42.73■■■■■ 4.43
ANKRD12-206ENST00000577992 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.6■■■■■ 4.41
ANKRD12-206ENST00000577992 HMGXB3Q12766 1538 aa42.56■■■■■ 4.4
ANKRD12-206ENST00000577992 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
ANKRD12-206ENST00000577992 WIZO95785 1651 aa42.35■■■■■ 4.37
ANKRD12-206ENST00000577992 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
ANKRD12-206ENST00000577992 NESP48681 1621 aa41.89■■■■■ 4.3
ANKRD12-206ENST00000577992 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
ANKRD12-206ENST00000577992 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.66■■■■■ 4.26
ANKRD12-206ENST00000577992 ERCC6Q03468 1493 aa41.65■■■■■ 4.26
ANKRD12-206ENST00000577992 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.51■■■■■ 4.24
ANKRD12-206ENST00000577992 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.39■■■■■ 4.22
ANKRD12-206ENST00000577992 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.35■■■■■ 4.21
ANKRD12-206ENST00000577992 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.34■■■■■ 4.21
ANKRD12-206ENST00000577992 CFTRP13569 1480 aa41.28■■■■■ 4.2
ANKRD12-206ENST00000577992 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
ANKRD12-206ENST00000577992 CUX2O14529 1486 aa41.2■■■■■ 4.19
ANKRD12-206ENST00000577992 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
ANKRD12-206ENST00000577992 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.09■■■■■ 4.17
ANKRD12-206ENST00000577992 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.02■■■■■ 4.16
ANKRD12-206ENST00000577992 PRDM2Q13029 1718 aa41.01■■■■■ 4.16
ANKRD12-206ENST00000577992 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.98■■■■■ 4.15
ANKRD12-206ENST00000577992 WDR62O43379 1518 aa40.87■■■■■ 4.13
ANKRD12-206ENST00000577992 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
ANKRD12-206ENST00000577992 TOPBP1Q92547 1522 aa40.44■■■■■ 4.06
ANKRD12-206ENST00000577992 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.36■■■■■ 4.05
ANKRD12-206ENST00000577992 ABCC8Q09428 1581 aa40.31■■■■■ 4.04
ANKRD12-206ENST00000577992 IFT140Q96RY7 1462 aa40.14■■■■■ 4.02
ANKRD12-206ENST00000577992 CUX1P39880 1505 aa40.14■■■■■ 4.02
ANKRD12-206ENST00000577992 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
ANKRD12-206ENST00000577992 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
ANKRD12-206ENST00000577992 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.05■■■■■ 4
ANKRD12-206ENST00000577992 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
ANKRD12-206ENST00000577992 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.99■■■■□ 3.99
ANKRD12-206ENST00000577992 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.95■■■■□ 3.99
ANKRD12-206ENST00000577992 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.89■■■■□ 3.98
ANKRD12-206ENST00000577992 SOGA1O94964 1423 aa39.89■■■■□ 3.98
ANKRD12-206ENST00000577992 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.81■■■■□ 3.96
ANKRD12-206ENST00000577992 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.79■■■■□ 3.96
ANKRD12-206ENST00000577992 SYNJ1O43426 1573 aa39.78■■■■□ 3.96
ANKRD12-206ENST00000577992 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.75■■■■□ 3.95
ANKRD12-206ENST00000577992 TOP2BQ02880 1626 aa39.73■■■■□ 3.95
ANKRD12-206ENST00000577992 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
ANKRD12-206ENST00000577992 WDR97A6NE52 1622 aa39.69■■■■□ 3.94
ANKRD12-206ENST00000577992 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.56■■■■□ 3.92
ANKRD12-206ENST00000577992 OSCARQ8IYS5 282 aa39.46■■■■□ 3.91
ANKRD12-206ENST00000577992 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.46■■■■□ 3.91
ANKRD12-206ENST00000577992 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.43■■■■□ 3.9
ANKRD12-206ENST00000577992 CHD1O14646 1710 aa39.43■■■■□ 3.9
ANKRD12-206ENST00000577992 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.43■■■■□ 3.9
ANKRD12-206ENST00000577992 GRIN2BQ13224 1484 aa39.42■■■■□ 3.9
ANKRD12-206ENST00000577992 PBRM1Q86U86 1689 aa39.41■■■■□ 3.9
ANKRD12-206ENST00000577992 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
ANKRD12-206ENST00000577992 FBLN2P98095 1184 aa39.3■■■■□ 3.88
ANKRD12-206ENST00000577992 SYNJ2O15056 1496 aa39.17■■■■□ 3.86
ANKRD12-206ENST00000577992 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
ANKRD12-206ENST00000577992 ADAMTS12P58397 1594 aa39.08■■■■□ 3.85
ANKRD12-206ENST00000577992 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.07■■■■□ 3.84
ANKRD12-206ENST00000577992 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.96■■■■□ 3.83
ANKRD12-206ENST00000577992 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.96■■■■□ 3.83
ANKRD12-206ENST00000577992 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.96■■■■□ 3.83
ANKRD12-206ENST00000577992 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.96■■■■□ 3.83
ANKRD12-206ENST00000577992 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.95■■■■□ 3.83
ANKRD12-206ENST00000577992 GRIN2AQ12879 1464 aa38.94■■■■□ 3.82
ANKRD12-206ENST00000577992 KIF27Q86VH2 1401 aa38.93■■■■□ 3.82
ANKRD12-206ENST00000577992 ARHGEF11O15085 1522 aa38.91■■■■□ 3.82
ANKRD12-206ENST00000577992 IGF1RP08069 1367 aa38.82■■■■□ 3.81
ANKRD12-206ENST00000577992 CEP170Q5SW79 1584 aa38.81■■■■□ 3.8
ANKRD12-206ENST00000577992 TRIM41Q8WV44 630 aa38.77■■■■□ 3.8
ANKRD12-206ENST00000577992 NUP160Q12769 1436 aa38.77■■■■□ 3.8
ANKRD12-206ENST00000577992 CUL7Q14999 1698 aa38.71■■■■□ 3.79
ANKRD12-206ENST00000577992 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.7■■■■□ 3.79
ANKRD12-206ENST00000577992 ARAP1Q96P48 1450 aa38.62■■■■□ 3.77
ANKRD12-206ENST00000577992 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.57■■■■□ 3.77
ANKRD12-206ENST00000577992 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.53■■■■□ 3.76
ANKRD12-206ENST00000577992 SHROOM2Q13796 1616 aa38.51■■■■□ 3.76
ANKRD12-206ENST00000577992 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.5■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms