RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529745.5

CCDC90B-215, Transcript of coiled-coil domain containing 90B, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC90B, Length 1,053 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90B-215ENST00000529745 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.17■■■■□ 3.7
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CCDC90B-215ENST00000529745 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.91■■■□□ 2.7
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CCDC90B-215ENST00000529745 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.66■■■□□ 2.66
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CCDC90B-215ENST00000529745 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.94■■■□□ 2.54
CCDC90B-215ENST00000529745 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.57■■■□□ 2.48
CCDC90B-215ENST00000529745 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.43■■■□□ 2.46
CCDC90B-215ENST00000529745 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.39■■■□□ 2.46
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CCDC90B-215ENST00000529745 SMARCA2P51531 1590 aa29.53■■■□□ 2.32
CCDC90B-215ENST00000529745 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.53■■■□□ 2.32
CCDC90B-215ENST00000529745 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.47■■■□□ 2.31
CCDC90B-215ENST00000529745 HMGXB3Q12766 1538 aa29.46■■■□□ 2.31
CCDC90B-215ENST00000529745 CUX2O14529 1486 aa29.44■■■□□ 2.3
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CCDC90B-215ENST00000529745 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
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CCDC90B-215ENST00000529745 NESP48681 1621 aa28.83■■■□□ 2.21
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CCDC90B-215ENST00000529745 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.64■■■□□ 2.18
CCDC90B-215ENST00000529745 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.61■■■□□ 2.17
CCDC90B-215ENST00000529745 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.59■■■□□ 2.17
CCDC90B-215ENST00000529745 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CCDC90B-215ENST00000529745 CFTRP13569 1480 aa28.48■■■□□ 2.15
CCDC90B-215ENST00000529745 PRDM2Q13029 1718 aa28.4■■■□□ 2.14
CCDC90B-215ENST00000529745 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.37■■■□□ 2.13
CCDC90B-215ENST00000529745 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.33■■■□□ 2.13
CCDC90B-215ENST00000529745 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.32■■■□□ 2.12
CCDC90B-215ENST00000529745 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.31■■■□□ 2.12
CCDC90B-215ENST00000529745 WDR62O43379 1518 aa28.29■■■□□ 2.12
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CCDC90B-215ENST00000529745 ABCC8Q09428 1581 aa27.9■■■□□ 2.06
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CCDC90B-215ENST00000529745 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
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CCDC90B-215ENST00000529745 ARHGEF11O15085 1522 aa27.48■■□□□ 1.99
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CCDC90B-215ENST00000529745 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
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CCDC90B-215ENST00000529745 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CCDC90B-215ENST00000529745 CHD1O14646 1710 aa27.26■■□□□ 1.95
CCDC90B-215ENST00000529745 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.25■■□□□ 1.95
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CCDC90B-215ENST00000529745 PBRM1Q86U86 1689 aa27.21■■□□□ 1.95
CCDC90B-215ENST00000529745 GRIN2BQ13224 1484 aa27.19■■□□□ 1.94
CCDC90B-215ENST00000529745 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CCDC90B-215ENST00000529745 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.15■■□□□ 1.94
CCDC90B-215ENST00000529745 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.15■■□□□ 1.94
CCDC90B-215ENST00000529745 ARAP1Q96P48 1450 aa27.15■■□□□ 1.94
CCDC90B-215ENST00000529745 SYNJ2O15056 1496 aa27.05■■□□□ 1.92
CCDC90B-215ENST00000529745 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.96■■□□□ 1.91
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CCDC90B-215ENST00000529745 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CCDC90B-215ENST00000529745 GRIN2AQ12879 1464 aa26.85■■□□□ 1.89
CCDC90B-215ENST00000529745 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.84■■□□□ 1.89
CCDC90B-215ENST00000529745 NUP160Q12769 1436 aa26.76■■□□□ 1.87
CCDC90B-215ENST00000529745 CEP170Q5SW79 1584 aa26.74■■□□□ 1.87
CCDC90B-215ENST00000529745 KIF27Q86VH2 1401 aa26.73■■□□□ 1.87
CCDC90B-215ENST00000529745 CUL7Q14999 1698 aa26.7■■□□□ 1.87
CCDC90B-215ENST00000529745 SHROOM2Q13796 1616 aa26.66■■□□□ 1.86
CCDC90B-215ENST00000529745 IGF1RP08069 1367 aa26.64■■□□□ 1.86
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