Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 M6PR-201ENST00000000412 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 RHBDD2-204ENST00000454791 1831 ntTSL 227.14■■□□□ 1.942e-20■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.862e-20■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.292e-20■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 RHBDD2-208ENST00000468644 555 ntTSL 413□□□□□ -0.332e-20■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 RHBDD2-205ENST00000466232 566 ntTSL 410.69□□□□□ -0.72e-20■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.371e-12■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 TOR3A-206ENST00000483887 1084 ntTSL 319.9■□□□□ 0.782e-13■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.722e-13■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.512e-13■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 TOR3A-202ENST00000367625 519 ntTSL 316.24■□□□□ 0.192e-13■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.819e-12■■■■■ 37
DDX3XO00571 MCM4-210ENST00000520934 621 ntTSL 324.85■■□□□ 1.575e-12■■■■■ 37
DDX3XO00571 MCM4-211ENST00000520994 522 ntTSL 321.4■■□□□ 1.025e-12■■■■■ 37
DDX3XO00571 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.345e-12■■■■■ 37
DDX3XO00571 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.245e-12■■■■■ 37
DDX3XO00571 MCM4-216ENST00000524086 547 ntTSL 512.61□□□□□ -0.395e-12■■■■■ 37
DDX3XO00571 MCM4-203ENST00000518221 572 ntTSL 411.66□□□□□ -0.545e-12■■■■■ 37
DDX3XO00571 VTI1B-201ENST00000216456 1103 ntTSL 1 (best)22.4■■□□□ 1.183e-37■■■■■ 37
DDX3XO00571 VTI1B-205ENST00000555543 718 ntTSL 221.07■□□□□ 0.963e-37■■■■■ 37
DDX3XO00571 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.113e-37■■■■■ 37
DDX3XO00571 AL049779.1-203ENST00000554493 364 ntTSL 25.73□□□□□ -1.493e-37■■■■■ 37
DDX3XO00571 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.623e-37■■■■■ 37
DDX3XO00571 AL049779.1-202ENST00000553582 498 ntTSL 24.42□□□□□ -1.73e-37■■■■■ 37
DDX3XO00571 AL049779.1-204ENST00000557564 274 ntAPPRIS P1 TSL 2-0.8□□□□□ -2.543e-37■■■■■ 37
DDX3XO00571 DPYSL2-203ENST00000493789 562 ntTSL 422.55■■□□□ 1.21e-12■■■■■ 37
DDX3XO00571 MRPS2-203ENST00000453385 810 ntTSL 219.46■□□□□ 0.711e-11■■■■■ 37
DDX3XO00571 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-12■■■■■ 37
DDX3XO00571 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.841e-12■■■■■ 37
DDX3XO00571 DDR1-255ENST00000504927 542 ntTSL 421.4■■□□□ 1.024e-8■■■■■ 37
DDX3XO00571 DDR1-266ENST00000511510 547 ntTSL 520.83■□□□□ 0.934e-8■■■■■ 37
DDX3XO00571 DDR1-274ENST00000513749 584 ntTSL 520.83■□□□□ 0.934e-8■■■■■ 37
DDX3XO00571 DDR1-265ENST00000509639 615 ntTSL 420.57■□□□□ 0.884e-8■■■■■ 37
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DDX3XO00571 DDR1-263ENST00000508317 538 ntTSL 416.44■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 37
DDX3XO00571 DDR1-229ENST00000396342 675 ntTSL 316.37■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 37
DDX3XO00571 DDR1-256ENST00000505066 556 ntTSL 416.37■□□□□ 0.214e-8■■■■■ 37
DDX3XO00571 DDR1-268ENST00000512694 623 ntTSL 416.14■□□□□ 0.174e-8■■■■■ 37
DDX3XO00571 DDR1-250ENST00000503628 570 ntTSL 415.95■□□□□ 0.144e-8■■■■■ 37
DDX3XO00571 DDR1-237ENST00000437124 587 ntTSL 415.14■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 37
DDX3XO00571 DDR1-278ENST00000515233 580 ntTSL 414.96□□□□□ -0.014e-8■■■■■ 37
DDX3XO00571 PLOD2-208ENST00000480704 550 ntTSL 415.66■□□□□ 0.12e-54■■■■■ 36.9
DDX3XO00571 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-54■■■■■ 36.9
DDX3XO00571 PAM-216ENST00000508060 369 ntTSL 410.37□□□□□ -0.757e-10■■■■■ 36.9
DDX3XO00571 TDRKH-210ENST00000486986 760 ntTSL 224.41■■□□□ 1.52e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.412e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.362e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.882e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 TDRKH-208ENST00000463553 371 ntTSL 316.54■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 WDR11-209ENST00000604585 1781 ntTSL 515.15■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 36.8
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DDX3XO00571 TDRKH-212ENST00000525790 2217 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 TDRKH-214ENST00000526413 1807 ntTSL 210□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.052e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.822e-27■■■■■ 36.8
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DDX3XO00571 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.354e-11■■■■■ 36.8
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DDX3XO00571 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.452e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.282e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.964e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.772e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 KLHL36-206ENST00000567410 585 ntTSL 319.34■□□□□ 0.692e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 PRNP-202ENST00000424424 806 ntTSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.675e-13■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.472e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.422e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.318e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-201ENST00000260054 1688 ntTSL 216.75■□□□□ 0.272e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.272e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.185e-13■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.155e-13■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-215ENST00000529745 1053 ntTSL 315.85■□□□□ 0.132e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 NAF1-203ENST00000502973 1159 ntTSL 215.53■□□□□ 0.082e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-11■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-216ENST00000529856 1039 ntTSL 313.13□□□□□ -0.312e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-205ENST00000525916 656 ntTSL 312.36□□□□□ -0.432e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-210ENST00000528149 987 ntTSL 312.11□□□□□ -0.472e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-211ENST00000529073 719 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.512e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-218ENST00000533761 1587 ntTSL 511.6□□□□□ -0.552e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 MITF-216ENST00000495741 473 ntTSL 411.51□□□□□ -0.578e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 MITF-213ENST00000461511 574 ntTSL 411.23□□□□□ -0.618e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-214ENST00000529689 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 MITF-209ENST00000448226 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.728e-8■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-206ENST00000526265 1433 ntTSL 210.55□□□□□ -0.722e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-217ENST00000530253 776 ntTSL 29.3□□□□□ -0.922e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-208ENST00000527025 777 ntTSL 59.17□□□□□ -0.942e-15■■■■■ 36.8
DDX3XO00571 CCDC90B-219ENST00000534753 723 ntTSL 59.12□□□□□ -0.952e-15■■■■■ 36.8
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