RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454791.1

RHBDD2-204, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene RHBDD2, Length 1,831 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-204ENST00000454791 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.74■■■■■ 6.99
RHBDD2-204ENST00000454791 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.42■■■■■ 5.82
RHBDD2-204ENST00000454791 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
RHBDD2-204ENST00000454791 ABCC9O60706 1549 aa49.15■■■■■ 5.46
RHBDD2-204ENST00000454791 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.68■■■■■ 5.38
RHBDD2-204ENST00000454791 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.57■■■■■ 5.37
RHBDD2-204ENST00000454791 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.21■■■■■ 5.31
RHBDD2-204ENST00000454791 NACADO15069 1562 aa48.06■■■■■ 5.28
RHBDD2-204ENST00000454791 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.77■■■■■ 5.24
RHBDD2-204ENST00000454791 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.51■■■■■ 5.2
RHBDD2-204ENST00000454791 SCRIBQ14160 1630 aa47.22■■■■■ 5.15
RHBDD2-204ENST00000454791 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.69■■■■■ 5.06
RHBDD2-204ENST00000454791 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.34■■■■■ 5.01
RHBDD2-204ENST00000454791 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.27■■■■■ 5
RHBDD2-204ENST00000454791 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.69■■■■■ 4.9
RHBDD2-204ENST00000454791 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.46■■■■■ 4.87
RHBDD2-204ENST00000454791 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
RHBDD2-204ENST00000454791 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.37■■■■■ 4.85
RHBDD2-204ENST00000454791 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.35■■■■■ 4.85
RHBDD2-204ENST00000454791 SMARCA4P51532 1647 aa45.24■■■■■ 4.83
RHBDD2-204ENST00000454791 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
RHBDD2-204ENST00000454791 WIZO95785 1651 aa44.92■■■■■ 4.78
RHBDD2-204ENST00000454791 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.73■■■■■ 4.75
RHBDD2-204ENST00000454791 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.67■■■■■ 4.74
RHBDD2-204ENST00000454791 SMARCA2P51531 1590 aa44.61■■■■■ 4.73
RHBDD2-204ENST00000454791 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
RHBDD2-204ENST00000454791 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.45■■■■■ 4.71
RHBDD2-204ENST00000454791 NCAPD3P42695 1498 aa44.39■■■■■ 4.7
RHBDD2-204ENST00000454791 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
RHBDD2-204ENST00000454791 HMGXB3Q12766 1538 aa44.25■■■■■ 4.67
RHBDD2-204ENST00000454791 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.02■■■■■ 4.64
RHBDD2-204ENST00000454791 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.87■■■■■ 4.61
RHBDD2-204ENST00000454791 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.25■■■■■ 4.51
RHBDD2-204ENST00000454791 CFTRP13569 1480 aa43.25■■■■■ 4.51
RHBDD2-204ENST00000454791 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.22■■■■■ 4.51
RHBDD2-204ENST00000454791 NESP48681 1621 aa42.98■■■■■ 4.47
RHBDD2-204ENST00000454791 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.94■■■■■ 4.46
RHBDD2-204ENST00000454791 ABCC8Q09428 1581 aa42.89■■■■■ 4.46
RHBDD2-204ENST00000454791 PRDM2Q13029 1718 aa42.87■■■■■ 4.45
RHBDD2-204ENST00000454791 TRIM41Q8WV44 630 aa42.81■■■■■ 4.44
RHBDD2-204ENST00000454791 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.72■■■■■ 4.43
RHBDD2-204ENST00000454791 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.71■■■■■ 4.43
RHBDD2-204ENST00000454791 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.66■■■■■ 4.42
RHBDD2-204ENST00000454791 SYNJ1O43426 1573 aa42.53■■■■■ 4.4
RHBDD2-204ENST00000454791 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.5■■■■■ 4.39
RHBDD2-204ENST00000454791 CUX1P39880 1505 aa42.44■■■■■ 4.38
RHBDD2-204ENST00000454791 TOP2BQ02880 1626 aa42.41■■■■■ 4.38
RHBDD2-204ENST00000454791 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.4■■■■■ 4.38
RHBDD2-204ENST00000454791 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.35■■■■■ 4.37
RHBDD2-204ENST00000454791 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.22■■■■■ 4.35
RHBDD2-204ENST00000454791 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
RHBDD2-204ENST00000454791 ERCC6Q03468 1493 aa42.2■■■■■ 4.35
RHBDD2-204ENST00000454791 TOPBP1Q92547 1522 aa42.19■■■■■ 4.34
RHBDD2-204ENST00000454791 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.12■■■■■ 4.33
RHBDD2-204ENST00000454791 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.06■■■■■ 4.32
RHBDD2-204ENST00000454791 SOGA1O94964 1423 aa42.01■■■■■ 4.32
RHBDD2-204ENST00000454791 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
RHBDD2-204ENST00000454791 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
RHBDD2-204ENST00000454791 WDR62O43379 1518 aa41.91■■■■■ 4.3
RHBDD2-204ENST00000454791 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
RHBDD2-204ENST00000454791 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.87■■■■■ 4.29
RHBDD2-204ENST00000454791 EEA1Q15075 1411 aa41.81■■■■■ 4.28
RHBDD2-204ENST00000454791 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.81■■■■■ 4.28
RHBDD2-204ENST00000454791 CUX2O14529 1486 aa41.69■■■■■ 4.26
RHBDD2-204ENST00000454791 KIF27Q86VH2 1401 aa41.69■■■■■ 4.26
RHBDD2-204ENST00000454791 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.69■■■■■ 4.26
RHBDD2-204ENST00000454791 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.66■■■■■ 4.26
RHBDD2-204ENST00000454791 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
RHBDD2-204ENST00000454791 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.56■■■■■ 4.24
RHBDD2-204ENST00000454791 WDR97A6NE52 1622 aa41.54■■■■■ 4.24
RHBDD2-204ENST00000454791 IFT140Q96RY7 1462 aa41.53■■■■■ 4.24
RHBDD2-204ENST00000454791 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
RHBDD2-204ENST00000454791 IGF1RP08069 1367 aa41.4■■■■■ 4.22
RHBDD2-204ENST00000454791 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.39■■■■■ 4.22
RHBDD2-204ENST00000454791 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.36■■■■■ 4.21
RHBDD2-204ENST00000454791 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.34■■■■■ 4.21
RHBDD2-204ENST00000454791 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
RHBDD2-204ENST00000454791 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.29■■■■■ 4.2
RHBDD2-204ENST00000454791 PRXQ9BXM0 1461 aa41.28■■■■■ 4.2
RHBDD2-204ENST00000454791 KIF21BO75037 1637 aa41.27■■■■■ 4.2
RHBDD2-204ENST00000454791 GOLGA3Q08378 1498 aa41.2■■■■■ 4.19
RHBDD2-204ENST00000454791 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.18■■■■■ 4.18
RHBDD2-204ENST00000454791 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.17■■■■■ 4.18
RHBDD2-204ENST00000454791 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.16■■■■■ 4.18
RHBDD2-204ENST00000454791 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
RHBDD2-204ENST00000454791 GRIN2BQ13224 1484 aa41.11■■■■■ 4.17
RHBDD2-204ENST00000454791 PBRM1Q86U86 1689 aa41.07■■■■■ 4.17
RHBDD2-204ENST00000454791 CUL7Q14999 1698 aa41.06■■■■■ 4.16
RHBDD2-204ENST00000454791 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
RHBDD2-204ENST00000454791 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.99■■■■■ 4.15
RHBDD2-204ENST00000454791 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.89■■■■■ 4.14
RHBDD2-204ENST00000454791 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.89■■■■■ 4.14
RHBDD2-204ENST00000454791 ADAMTS12P58397 1594 aa40.87■■■■■ 4.13
RHBDD2-204ENST00000454791 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
RHBDD2-204ENST00000454791 CEP162Q5TB80 1403 aa40.71■■■■■ 4.11
RHBDD2-204ENST00000454791 SYNJ2O15056 1496 aa40.67■■■■■ 4.1
RHBDD2-204ENST00000454791 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
RHBDD2-204ENST00000454791 GRIN2AQ12879 1464 aa40.59■■■■■ 4.09
RHBDD2-204ENST00000454791 FBLN2P98095 1184 aa40.56■■■■■ 4.08
RHBDD2-204ENST00000454791 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.5 ms