Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.615e-7■□□□□ 9
SRSF7Q16629 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.382e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.732e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 CHD4-208ENST00000540960 892 ntTSL 57.11□□□□□ -1.272e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 CHD4-205ENST00000536301 107 ntTSL 34.07□□□□□ -1.762e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.236e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.936e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.766e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.696e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.556e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 317.87■□□□□ 0.456e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.426e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.317e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 UBE2Z-205ENST00000508468 573 ntTSL 316.78■□□□□ 0.286e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-221ENST00000633899 591 ntTSL 416.56■□□□□ 0.246e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.196e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-208ENST00000465149 5380 ntTSL 216.24■□□□□ 0.197e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.187e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.077e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.056e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.017e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-209ENST00000465589 571 ntTSL 315.02■□□□□ -07e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-207ENST00000520058 559 ntTSL 214.71□□□□□ -0.056e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.086e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-212ENST00000491370 584 ntTSL 414.34□□□□□ -0.117e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-212ENST00000522912 2047 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.126e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-215ENST00000482693 755 ntTSL 213.55□□□□□ -0.246e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-207ENST00000413951 623 ntTSL 213.34□□□□□ -0.276e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-208ENST00000432725 475 ntTSL 413.22□□□□□ -0.296e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.346e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-214ENST00000523851 458 ntTSL 312.85□□□□□ -0.356e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.366e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 512.66□□□□□ -0.386e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-209ENST00000520953 2172 ntTSL 512.42□□□□□ -0.426e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.436e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.467e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.526e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.526e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.566e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.626e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.86e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.856e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.896e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 MAPK13-205ENST00000490334 649 ntTSL 58.72□□□□□ -1.016e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZNF189-204ENST00000615466 2316 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.176e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-215ENST00000524111 4074 ntTSL 57.2□□□□□ -1.266e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.376e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 MAPK13-204ENST00000476951 499 ntTSL 35.22□□□□□ -1.576e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.66e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 SREK1-210ENST00000521691 580 ntTSL 33.51□□□□□ -1.856e-7■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 514.21□□□□□ -0.137e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 514□□□□□ -0.177e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 513.59□□□□□ -0.237e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.237e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.37e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.357e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 512.44□□□□□ -0.427e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.447e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 311.14□□□□□ -0.637e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 58.58□□□□□ -1.047e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPU-202ENST00000366525 2851 ntTSL 58.27□□□□□ -1.097e-20■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 513.03□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 211.49□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.893e-8■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.939e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 PNISR-207ENST00000478777 2422 ntTSL 27.9□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.159e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-206ENST00000487510 579 ntTSL 26.65□□□□□ -1.349e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.392e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-203ENST00000473260 482 ntTSL 26.25□□□□□ -1.419e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 HNRNPA2B1-205ENST00000476233 1220 ntTSL 1 (best)5.54□□□□□ -1.522e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-205ENST00000479947 470 ntTSL 25.54□□□□□ -1.529e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 PNISR-206ENST00000476159 537 ntTSL 35.3□□□□□ -1.562e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 PNISR-203ENST00000460600 2178 ntTSL 24.44□□□□□ -1.72e-6■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.819e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZRANB2-204ENST00000477096 3677 ntTSL 1 (best)1.62□□□□□ -2.159e-10■□□□□ 8.9
SRSF7Q16629 ZNF638-222ENST00000491843 332 ntTSL 35.89□□□□□ -1.473e-8■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.47e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.557e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-204ENST00000311420 1583 ntTSL 58.77□□□□□ -1.017e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-202ENST00000258149 12633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.37e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-222ENST00000523991 505 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.337e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-220ENST00000496959 897 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.357e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-212ENST00000393416 754 ntTSL 56.2□□□□□ -1.427e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-213ENST00000393417 1683 ntTSL 55.87□□□□□ -1.477e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-230ENST00000543323 427 ntTSL 1 (best)5.31□□□□□ -1.567e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-225ENST00000539479 845 ntTSL 1 (best)5.2□□□□□ -1.587e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.597e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-228ENST00000542502 1127 ntTSL 1 (best)4.92□□□□□ -1.627e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-224ENST00000537182 1011 ntTSL 1 (best)4.84□□□□□ -1.637e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-211ENST00000393415 842 ntTSL 54.72□□□□□ -1.657e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.667e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.687e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.737e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-226ENST00000540352 1315 ntTSL 1 (best)4.22□□□□□ -1.737e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-218ENST00000481186 1056 ntTSL 54.18□□□□□ -1.747e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-223ENST00000536089 1181 ntTSL 1 (best)4.18□□□□□ -1.747e-7■□□□□ 8.8
SRSF7Q16629 MDM2-234ENST00000546048 363 ntTSL 53.92□□□□□ -1.787e-7■□□□□ 8.8
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