RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366607.4

TOMM20-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM20, Length 3,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20-201ENST00000366607 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.46■■□□□ 1.03
TOMM20-201ENST00000366607 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.8■□□□□ 0.76
TOMM20-201ENST00000366607 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.66■□□□□ 0.74
TOMM20-201ENST00000366607 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
TOMM20-201ENST00000366607 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.2■□□□□ 0.66
TOMM20-201ENST00000366607 HRCP23327 699 aa19.2■□□□□ 0.66
TOMM20-201ENST00000366607 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
TOMM20-201ENST00000366607 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.87■□□□□ 0.61
TOMM20-201ENST00000366607 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.87■□□□□ 0.61
TOMM20-201ENST00000366607 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.71■□□□□ 0.59
TOMM20-201ENST00000366607 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.48■□□□□ 0.55
TOMM20-201ENST00000366607 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TOMM20-201ENST00000366607 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TOMM20-201ENST00000366607 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
TOMM20-201ENST00000366607 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
TOMM20-201ENST00000366607 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.13■□□□□ 0.49
TOMM20-201ENST00000366607 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
TOMM20-201ENST00000366607 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
TOMM20-201ENST00000366607 TRIM41Q8WV44 630 aa17.92■□□□□ 0.46
TOMM20-201ENST00000366607 ABCC9O60706 1549 aa17.9■□□□□ 0.46
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.88■□□□□ 0.45
TOMM20-201ENST00000366607 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
TOMM20-201ENST00000366607 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
TOMM20-201ENST00000366607 NEUROD1Q13562 356 aa17.82■□□□□ 0.44
TOMM20-201ENST00000366607 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
TOMM20-201ENST00000366607 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa17.75■□□□□ 0.43
TOMM20-201ENST00000366607 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
TOMM20-201ENST00000366607 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
TOMM20-201ENST00000366607 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
TOMM20-201ENST00000366607 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.59■□□□□ 0.41
TOMM20-201ENST00000366607 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TOMM20-201ENST00000366607 SCRIBQ14160 1630 aa17.51■□□□□ 0.39
TOMM20-201ENST00000366607 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
TOMM20-201ENST00000366607 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
TOMM20-201ENST00000366607 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.29■□□□□ 0.36
TOMM20-201ENST00000366607 MYT1Q01538 1121 aa17.22■□□□□ 0.35
TOMM20-201ENST00000366607 MIER1Q8N108 512 aa17.22■□□□□ 0.35
TOMM20-201ENST00000366607 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
TOMM20-201ENST00000366607 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.19■□□□□ 0.34
TOMM20-201ENST00000366607 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
TOMM20-201ENST00000366607 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
TOMM20-201ENST00000366607 CEP162Q5TB80 1403 aa16.91■□□□□ 0.3
TOMM20-201ENST00000366607 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.91■□□□□ 0.3
TOMM20-201ENST00000366607 NACADO15069 1562 aa16.87■□□□□ 0.29
TOMM20-201ENST00000366607 SOGA1O94964 1423 aa16.85■□□□□ 0.29
TOMM20-201ENST00000366607 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.84■□□□□ 0.29
TOMM20-201ENST00000366607 ABCC8Q09428 1581 aa16.84■□□□□ 0.29
TOMM20-201ENST00000366607 BCANQ96GW7 911 aa16.83■□□□□ 0.28
TOMM20-201ENST00000366607 WIZO95785 1651 aa16.83■□□□□ 0.28
TOMM20-201ENST00000366607 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.82■□□□□ 0.28
TOMM20-201ENST00000366607 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
TOMM20-201ENST00000366607 APLP2Q06481 763 aa16.78■□□□□ 0.28
TOMM20-201ENST00000366607 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.77■□□□□ 0.27
TOMM20-201ENST00000366607 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.263e-7■□□□□ 10.7
TOMM20-201ENST00000366607 TNIKQ9UKE5 1360 aa16.69■□□□□ 0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ITGAEP38570 1179 aa16.68■□□□□ 0.26
TOMM20-201ENST00000366607 KCNH8Q96L42 1107 aa16.68■□□□□ 0.26
TOMM20-201ENST00000366607 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.68■□□□□ 0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
TOMM20-201ENST00000366607 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.6■□□□□ 0.25
TOMM20-201ENST00000366607 FKBP8Q14318 412 aa16.55■□□□□ 0.24
TOMM20-201ENST00000366607 BCL11AQ9H165 835 aa16.55■□□□□ 0.24
TOMM20-201ENST00000366607 CLIP1P30622 1438 aa16.51■□□□□ 0.23
TOMM20-201ENST00000366607 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
TOMM20-201ENST00000366607 GOLGA3Q08378 1498 aa16.49■□□□□ 0.23
TOMM20-201ENST00000366607 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
TOMM20-201ENST00000366607 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
TOMM20-201ENST00000366607 P3H3Q8IVL6 736 aa16.45■□□□□ 0.22
TOMM20-201ENST00000366607 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
TOMM20-201ENST00000366607 TRIM52Q96A61 297 aa16.43■□□□□ 0.22
TOMM20-201ENST00000366607 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TOMM20-201ENST00000366607 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
TOMM20-201ENST00000366607 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.35■□□□□ 0.21
TOMM20-201ENST00000366607 NEFLP07196 543 aa16.35■□□□□ 0.21
TOMM20-201ENST00000366607 EEA1Q15075 1411 aa16.35■□□□□ 0.21
TOMM20-201ENST00000366607 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.34■□□□□ 0.21
TOMM20-201ENST00000366607 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
TOMM20-201ENST00000366607 SMARCA2P51531 1590 aa16.32■□□□□ 0.2
TOMM20-201ENST00000366607 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
TOMM20-201ENST00000366607 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa16.31■□□□□ 0.2
TOMM20-201ENST00000366607 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.31■□□□□ 0.2
TOMM20-201ENST00000366607 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
TOMM20-201ENST00000366607 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.3■□□□□ 0.2
TOMM20-201ENST00000366607 ARID3CA6NKF2 412 aa16.28■□□□□ 0.2
TOMM20-201ENST00000366607 SMARCA4P51532 1647 aa16.25■□□□□ 0.19
TOMM20-201ENST00000366607 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TOMM20-201ENST00000366607 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.24■□□□□ 0.19
TOMM20-201ENST00000366607 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TOMM20-201ENST00000366607 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.19■□□□□ 0.18
TOMM20-201ENST00000366607 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.19■□□□□ 0.18
TOMM20-201ENST00000366607 KIF21BO75037 1637 aa16.18■□□□□ 0.18
TOMM20-201ENST00000366607 MSH5O43196 834 aa16.17■□□□□ 0.18
TOMM20-201ENST00000366607 SYNJ1O43426 1573 aa16.15■□□□□ 0.18
TOMM20-201ENST00000366607 ANP32CO43423 234 aa16.14■□□□□ 0.17
TOMM20-201ENST00000366607 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.13■□□□□ 0.17
TOMM20-201ENST00000366607 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.13■□□□□ 0.17
TOMM20-201ENST00000366607 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.11■□□□□ 0.17
TOMM20-201ENST00000366607 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.1■□□□□ 0.17
TOMM20-201ENST00000366607 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.17
TOMM20-201ENST00000366607 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms