Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 CCDC137-204ENST00000574107 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.85■■□□□ 1.253e-7■■■■□ 25.1
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FAM120AQ9NZB2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.082e-13■■■■□ 25.1
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FAM120AQ9NZB2 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.043e-7■■■■□ 25.1
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FAM120AQ9NZB2 CTTN-208ENST00000498223 523 ntTSL 311.97□□□□□ -0.499e-7■■■■□ 25.1
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FAM120AQ9NZB2 NSMCE1-204ENST00000563273 626 ntTSL 313.29□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 25.1
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FAM120AQ9NZB2 NSMCE1-209ENST00000565384 580 ntTSL 312.85□□□□□ -0.352e-6■■■■□ 25.1
FAM120AQ9NZB2 NSMCE1-211ENST00000566087 878 ntTSL 511.51□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 25.1
FAM120AQ9NZB2 NSMCE1-203ENST00000562039 260 ntTSL 310.22□□□□□ -0.772e-6■■■■□ 25.1
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FAM120AQ9NZB2 GORASP1-212ENST00000452389 2933 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.481e-8■■■■□ 25.1
FAM120AQ9NZB2 GORASP1-211ENST00000441302 3240 ntTSL 216.2■□□□□ 0.181e-8■■■■□ 25.1
FAM120AQ9NZB2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.031e-8■■■■□ 25.1
FAM120AQ9NZB2 GORASP1-213ENST00000453680 2873 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.181e-8■■■■□ 25.1
FAM120AQ9NZB2 NCOA2-202ENST00000518287 6087 ntTSL 57.05□□□□□ -1.281e-8■■■■□ 25.1
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FAM120AQ9NZB2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.421e-16■■■■□ 25.1
FAM120AQ9NZB2 PDAP1-204ENST00000496335 302 ntTSL 315.63■□□□□ 0.091e-16■■■■□ 25.1
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FAM120AQ9NZB2 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.629e-13■■■■□ 25.1
FAM120AQ9NZB2 EPB41L1-219ENST00000636016 6665 ntTSL 210.21□□□□□ -0.779e-13■■■■□ 25.1
FAM120AQ9NZB2 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.979e-13■■■■□ 25.1
FAM120AQ9NZB2 EPB41L1-211ENST00000432603 864 ntTSL 37.33□□□□□ -1.249e-13■■■■□ 25.1
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