RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.43■■□□□ 1.82
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ZBED1-203ENST00000381223 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.04■■□□□ 1.6
ZBED1-203ENST00000381223 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.09■■□□□ 1.45
ZBED1-203ENST00000381223 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
ZBED1-203ENST00000381223 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.41■■□□□ 1.34
ZBED1-203ENST00000381223 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
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ZBED1-203ENST00000381223 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.87■■□□□ 1.25
ZBED1-203ENST00000381223 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.87■■□□□ 1.25
ZBED1-203ENST00000381223 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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ZBED1-203ENST00000381223 HRCP23327 699 aa22.35■■□□□ 1.17
ZBED1-203ENST00000381223 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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ZBED1-203ENST00000381223 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
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ZBED1-203ENST00000381223 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.48■■□□□ 1.03
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ZBED1-203ENST00000381223 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
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ZBED1-203ENST00000381223 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
ZBED1-203ENST00000381223 TRIM52Q96A61 297 aa20.91■□□□□ 0.94
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ZBED1-203ENST00000381223 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
ZBED1-203ENST00000381223 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
ZBED1-203ENST00000381223 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
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ZBED1-203ENST00000381223 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.47■□□□□ 0.87
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ZBED1-203ENST00000381223 TONSLQ96HA7 1378 aa20.33■□□□□ 0.85
ZBED1-203ENST00000381223 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.3■□□□□ 0.84
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ZBED1-203ENST00000381223 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.14■□□□□ 0.81
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ZBED1-203ENST00000381223 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.1■□□□□ 0.81
ZBED1-203ENST00000381223 CUX2O14529 1486 aa20.09■□□□□ 0.81
ZBED1-203ENST00000381223 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
ZBED1-203ENST00000381223 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.06■□□□□ 0.8
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ZBED1-203ENST00000381223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ZBED1-203ENST00000381223 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ZBED1-203ENST00000381223 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.04■□□□□ 0.8
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