RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.76□□□□□ -1.17
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ANKRD28-202ENST00000412318 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.86□□□□□ -1.31
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ANKRD28-202ENST00000412318 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.69□□□□□ -1.34
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ANKRD28-202ENST00000412318 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD28-202ENST00000412318 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.48□□□□□ -1.37
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ANKRD28-202ENST00000412318 ITGAEP38570 1179 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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ANKRD28-202ENST00000412318 SMARCA4P51532 1647 aa6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.39□□□□□ -1.39
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ANKRD28-202ENST00000412318 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.39□□□□□ -1.39
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ANKRD28-202ENST00000412318 ARID3CA6NKF2 412 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO41Q8TF61 875 aa6.37□□□□□ -1.39
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ANKRD28-202ENST00000412318 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 SOCS7O14512 581 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR97A6NE52 1622 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 CHD1O14646 1710 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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ANKRD28-202ENST00000412318 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.29□□□□□ -1.4
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