RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD28-202ENST00000412318 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.04□□□□□ -1.12
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCC9O60706 1549 aa7.83□□□□□ -1.16
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.68□□□□□ -1.18
ANKRD28-202ENST00000412318 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.48□□□□□ -1.21
ANKRD28-202ENST00000412318 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.38□□□□□ -1.23
ANKRD28-202ENST00000412318 MYT1Q01538 1121 aa7.38□□□□□ -1.23
ANKRD28-202ENST00000412318 NACADO15069 1562 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-202ENST00000412318 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-202ENST00000412318 CUX2O14529 1486 aa7.31□□□□□ -1.24
ANKRD28-202ENST00000412318 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ANKRD28-202ENST00000412318 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-202ENST00000412318 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-202ENST00000412318 BICRAQ9NZM4 1560 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-202ENST00000412318 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-202ENST00000412318 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-202ENST00000412318 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-202ENST00000412318 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM41Q8WV44 630 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-202ENST00000412318 APLP2Q06481 763 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-202ENST00000412318 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-202ENST00000412318 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-202ENST00000412318 ERCC6Q03468 1493 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-202ENST00000412318 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD28-202ENST00000412318 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
ANKRD28-202ENST00000412318 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-202ENST00000412318 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-202ENST00000412318 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-202ENST00000412318 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ANKRD28-202ENST00000412318 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
ANKRD28-202ENST00000412318 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-202ENST00000412318 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ANKRD28-202ENST00000412318 NCAPD3P42695 1498 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-202ENST00000412318 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-202ENST00000412318 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-202ENST00000412318 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.7□□□□□ -1.34
ANKRD28-202ENST00000412318 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa6.69□□□□□ -1.34
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-202ENST00000412318 SCRIBQ14160 1630 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-202ENST00000412318 HMGXB3Q12766 1538 aa6.68□□□□□ -1.34
ANKRD28-202ENST00000412318 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.65□□□□□ -1.34
ANKRD28-202ENST00000412318 HRCP23327 699 aa6.65□□□□□ -1.35
ANKRD28-202ENST00000412318 FBLN2P98095 1184 aa6.65□□□□□ -1.35
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR62O43379 1518 aa6.64□□□□□ -1.35
ANKRD28-202ENST00000412318 OSCARQ8IYS5 282 aa6.63□□□□□ -1.35
ANKRD28-202ENST00000412318 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ANKRD28-202ENST00000412318 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGEF11O15085 1522 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-202ENST00000412318 PDS5BQ9NTI5 1447 aa6.59□□□□□ -1.35
ANKRD28-202ENST00000412318 MRC2Q9UBG0 1479 aa6.59□□□□□ -1.36
ANKRD28-202ENST00000412318 SMARCA2P51531 1590 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.58□□□□□ -1.36
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC24A1O60721 1099 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD28-202ENST00000412318 NESP48681 1621 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-202ENST00000412318 NEFLP07196 543 aa6.53□□□□□ -1.36
ANKRD28-202ENST00000412318 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-202ENST00000412318 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-202ENST00000412318 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD28-202ENST00000412318 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.51□□□□□ -1.37
ANKRD28-202ENST00000412318 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.48□□□□□ -1.37
ANKRD28-202ENST00000412318 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
ANKRD28-202ENST00000412318 CHIC1Q5VXU3 224 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-202ENST00000412318 ARAP1Q96P48 1450 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-202ENST00000412318 TRHP20396 242 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 ITGAEP38570 1179 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 SMARCA4P51532 1647 aa6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 P3H3Q8IVL6 736 aa6.39□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 ARID3CA6NKF2 412 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO41Q8TF61 875 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 IFT140Q96RY7 1462 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 SOCS7O14512 581 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-202ENST00000412318 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 WDR97A6NE52 1622 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 CHD1O14646 1710 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 TRIM52Q96A61 297 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-202ENST00000412318 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms