RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361439.8

NSMCE1-201, Transcript of NSE1 homolog, SMC5-SMC6 complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NSMCE1, Length 1,067 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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NSMCE1-201ENST00000361439 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.29■■□□□ 1.96
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NSMCE1-201ENST00000361439 NCAPD3P42695 1498 aa25.27■■□□□ 1.64
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NSMCE1-201ENST00000361439 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.36■■□□□ 1.33
NSMCE1-201ENST00000361439 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.33■■□□□ 1.33
NSMCE1-201ENST00000361439 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.31■■□□□ 1.32
NSMCE1-201ENST00000361439 GRIN2BQ13224 1484 aa23.3■■□□□ 1.32
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NSMCE1-201ENST00000361439 PBRM1Q86U86 1689 aa23.18■■□□□ 1.3
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NSMCE1-201ENST00000361439 FBLN2P98095 1184 aa23.01■■□□□ 1.27
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NSMCE1-201ENST00000361439 CHD1O14646 1710 aa22.96■■□□□ 1.27
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NSMCE1-201ENST00000361439 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.92■■□□□ 1.26
NSMCE1-201ENST00000361439 NUP160Q12769 1436 aa22.89■■□□□ 1.25
NSMCE1-201ENST00000361439 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
NSMCE1-201ENST00000361439 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1-201ENST00000361439 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1-201ENST00000361439 CEP170Q5SW79 1584 aa22.8■■□□□ 1.24
NSMCE1-201ENST00000361439 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.77■■□□□ 1.24
NSMCE1-201ENST00000361439 KIF21BO75037 1637 aa22.76■■□□□ 1.23
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